设置以防止 R 更新使用 apt 安装的库

Question

有人能告诉我如何设置 .Rprofile 或 .Renviron 文件以防止系统升级通过 Ubuntu 的 apt 包管理系统安装的库吗？似乎 on 应该能够将 update.packages() 的选项设置为只查看，比如说，'/usr/local/lib/R/site-library'。

谢谢，

麦克

Answer 1

这部分起作用，因为我可以将单个值分配给默认值 lib.loc。

library(default) ## Load library
default(update.packages) <- list(lib.loc="/usr/local/lib/R/site-library")
> default(update.packages)
* - lib.loc = "/usr/local/lib/R/site-library"
  - repos = getOption("repos")
  - contriburl = contrib.url(repos, type)
  - method = [none]
  - instlib = NULL
  - ask = TRUE
  - available = NULL
  - oldPkgs = NULL
  - ... = [none]
  - checkBuilt = FALSE
  - type = getOption("pkgType")

我不明白为什么在使用多个值时它不起作用。例如，这里的默认值都是靠不住的。

default(update.packages) <- list(lib.loc=c("/usr/local/lib/R/site-library", "/home/<user>/R/lib/4.1")
> default(update.packages)
* - c("lib.loc = \"/usr/local/lib/R/site-library\"", "lib.loc = \"/home/<user>/R/lib\"")
  - repos = getOption("repos")
  - contriburl = contrib.url(repos, type)
  - method = [none]
  - instlib = NULL
  - ask = TRUE
  - available = NULL
  - oldPkgs = NULL
  - ... = [none]
  - checkBuilt = FALSE
  - type = getOption("pkgType")

设置以防止 R 更新使用 apt 安装的库

Setting to prevent R from updating libraries installed using apt

r

options

libraries