如何自定义 Seaborn 热图中颜色条的位置?
How to customize the location of color bar in Seaborn heatmap?
我有以下代码来创建热图。但是,它会创建颜色条和右轴文本的重叠。文字没问题,我要那个长度
如何在热图的 right/left 侧找到没有重叠的颜色条?
我尝试在 cbar_kws 中使用“pad”参数,但它没有帮助。enter image description here
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
PT=pd.DataFrame(np.random.randn(300,3), columns=list('ABC'))
miniPT=PT.iloc[:,:-1]
SMALL_SIZE = 8
MEDIUM_SIZE = 80
BIGGER_SIZE = 120
plt.rc('font', size=MEDIUM_SIZE) # controls default text sizes
plt.rc('axes', titlesize=MEDIUM_SIZE) # fontsize of the axes title
plt.rc('axes', labelsize=MEDIUM_SIZE) # fontsize of the x and y labels
plt.rc('xtick', labelsize=MEDIUM_SIZE) # fontsize of the tick labels
plt.rc('ytick', labelsize=SMALL_SIZE) # fontsize of the tick labels
plt.rc('legend', fontsize=MEDIUM_SIZE) # legend fontsize
plt.rc('figure', titlesize=BIGGER_SIZE) # fontsize of the figure title
plt.figure(figsize=(10, miniPT.shape[0]/5.2))
ax =sns.heatmap(miniPT, annot=False, cmap='RdYlGn')
for _, spine in ax.spines.items():
spine.set_visible(True)
# second axis
asset_list=np.asarray(PT['C'])
asset_list=asset_list[::-1]
ax3 = ax.twinx()
ax3.set_ylim([0,ax.get_ylim()[1]])
ax3.set_yticks(ax.get_yticks())
ax3.set_yticklabels(asset_list, fontsize=MEDIUM_SIZE*0.6)
# colorbar
cbar = ax.collections[0].colorbar
cbar.ax.tick_params(labelsize=MEDIUM_SIZE)
让 matplotlib 自动调整重叠的一种方法是显式创建子图:一个用于热图,另一个用于颜色条。 sns.heatmap
的 cbar_ax=
参数可以设置为指向这个子图。需要 gridspec_kws=
来设置相对大小。最后,plt.tight_layout()
将调整所有填充以使一切都很好。
问题的代码包含一些奇怪的设置(例如 80 的字体大小很大)。此外,300 行将不可避免地导致文本重叠(字体大小需要小到非重叠文本不可读)。这是一些更简化的示例代码:
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
PT = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 3), columns=list('ABC'))
fig, (ax, cbar_ax) = plt.subplots(ncols=2, figsize=(10, len(PT) / 5.2), gridspec_kw={'width_ratios': [10, 1]})
sns.heatmap(PT.iloc[:, :-1], annot=False, cmap='RdYlGn', cbar_ax=cbar_ax, ax=ax)
for _, spine in ax.spines.items():
spine.set_visible(True)
# second axis
asset_list = np.asarray(PT['C'])
ax3 = ax.twinx()
ax3.set_ylim(ax.get_ylim())
ax3.set_yticks(np.arange(len(PT)))
ax3.set_yticklabels(asset_list, fontsize=80)
# colorbar
cbar_ax.tick_params(labelsize=80)
plt.tight_layout()
plt.show()
由于图比较大,这里只贴下半部分,link为全图
这是它的样子:
- fontsize 80(请注意,字体大小以“每英寸点数”衡量,标准为每英寸 72 点);
- 图形宽度为 20 英寸(而不是 10 英寸);
- 300 行
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
PT = pd.DataFrame(np.random.randn(300, 3), columns=list('ABC'))
fig, (ax, cbar_ax) = plt.subplots(ncols=2, figsize=(20, len(PT) / 5.2), gridspec_kw={'width_ratios': [15, 1]})
sns.heatmap(PT.iloc[:, :-1], annot=False, cmap='RdYlGn', cbar_ax=cbar_ax, ax=ax)
for _, spine in ax.spines.items():
spine.set_visible(True)
# second axis
asset_list = np.asarray(PT['C'])
ax3 = ax.twinx()
ax3.set_ylim(ax.get_ylim())
ax3.set_yticks(np.arange(len(PT)))
ax3.set_yticklabels(asset_list, fontsize=80)
# colorbar
cbar_ax.tick_params(labelsize=80)
plt.tight_layout()
plt.show()
我的解决方案最终是将颜色条移到左侧。这是代码和输出:
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
PT = pd.DataFrame(np.random.randn(300, 3), columns=list('ABC'))
fig, (ax0, ax1) = plt.subplots(ncols=2, figsize=(10, len(PT) / 5.2), gridspec_kw={'width_ratios': [15, 15]})
sns.heatmap(PT.iloc[:, :-1], annot=False, cmap='RdYlGn', cbar_ax=ax0, ax=ax1)
for _, spine in ax1.spines.items():
spine.set_visible(True)
# second axis
asset_list = np.asarray(PT['C'])
ax3 = ax1.twinx()
ax3.set_ylim(ax1.get_ylim())
ax3.set_yticks(np.arange(len(PT)))
ax3.set_yticklabels(asset_list, fontsize=80)
# colorbar
ax0.tick_params(labelsize=80)
plt.tight_layout()
plt.show()
我有以下代码来创建热图。但是,它会创建颜色条和右轴文本的重叠。文字没问题,我要那个长度
如何在热图的 right/left 侧找到没有重叠的颜色条? 我尝试在 cbar_kws 中使用“pad”参数,但它没有帮助。enter image description here
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
PT=pd.DataFrame(np.random.randn(300,3), columns=list('ABC'))
miniPT=PT.iloc[:,:-1]
SMALL_SIZE = 8
MEDIUM_SIZE = 80
BIGGER_SIZE = 120
plt.rc('font', size=MEDIUM_SIZE) # controls default text sizes
plt.rc('axes', titlesize=MEDIUM_SIZE) # fontsize of the axes title
plt.rc('axes', labelsize=MEDIUM_SIZE) # fontsize of the x and y labels
plt.rc('xtick', labelsize=MEDIUM_SIZE) # fontsize of the tick labels
plt.rc('ytick', labelsize=SMALL_SIZE) # fontsize of the tick labels
plt.rc('legend', fontsize=MEDIUM_SIZE) # legend fontsize
plt.rc('figure', titlesize=BIGGER_SIZE) # fontsize of the figure title
plt.figure(figsize=(10, miniPT.shape[0]/5.2))
ax =sns.heatmap(miniPT, annot=False, cmap='RdYlGn')
for _, spine in ax.spines.items():
spine.set_visible(True)
# second axis
asset_list=np.asarray(PT['C'])
asset_list=asset_list[::-1]
ax3 = ax.twinx()
ax3.set_ylim([0,ax.get_ylim()[1]])
ax3.set_yticks(ax.get_yticks())
ax3.set_yticklabels(asset_list, fontsize=MEDIUM_SIZE*0.6)
# colorbar
cbar = ax.collections[0].colorbar
cbar.ax.tick_params(labelsize=MEDIUM_SIZE)
让 matplotlib 自动调整重叠的一种方法是显式创建子图:一个用于热图,另一个用于颜色条。 sns.heatmap
的 cbar_ax=
参数可以设置为指向这个子图。需要 gridspec_kws=
来设置相对大小。最后,plt.tight_layout()
将调整所有填充以使一切都很好。
问题的代码包含一些奇怪的设置(例如 80 的字体大小很大)。此外,300 行将不可避免地导致文本重叠(字体大小需要小到非重叠文本不可读)。这是一些更简化的示例代码:
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
PT = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 3), columns=list('ABC'))
fig, (ax, cbar_ax) = plt.subplots(ncols=2, figsize=(10, len(PT) / 5.2), gridspec_kw={'width_ratios': [10, 1]})
sns.heatmap(PT.iloc[:, :-1], annot=False, cmap='RdYlGn', cbar_ax=cbar_ax, ax=ax)
for _, spine in ax.spines.items():
spine.set_visible(True)
# second axis
asset_list = np.asarray(PT['C'])
ax3 = ax.twinx()
ax3.set_ylim(ax.get_ylim())
ax3.set_yticks(np.arange(len(PT)))
ax3.set_yticklabels(asset_list, fontsize=80)
# colorbar
cbar_ax.tick_params(labelsize=80)
plt.tight_layout()
plt.show()
由于图比较大,这里只贴下半部分,link为全图
这是它的样子:
- fontsize 80(请注意,字体大小以“每英寸点数”衡量,标准为每英寸 72 点);
- 图形宽度为 20 英寸(而不是 10 英寸);
- 300 行
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
PT = pd.DataFrame(np.random.randn(300, 3), columns=list('ABC'))
fig, (ax, cbar_ax) = plt.subplots(ncols=2, figsize=(20, len(PT) / 5.2), gridspec_kw={'width_ratios': [15, 1]})
sns.heatmap(PT.iloc[:, :-1], annot=False, cmap='RdYlGn', cbar_ax=cbar_ax, ax=ax)
for _, spine in ax.spines.items():
spine.set_visible(True)
# second axis
asset_list = np.asarray(PT['C'])
ax3 = ax.twinx()
ax3.set_ylim(ax.get_ylim())
ax3.set_yticks(np.arange(len(PT)))
ax3.set_yticklabels(asset_list, fontsize=80)
# colorbar
cbar_ax.tick_params(labelsize=80)
plt.tight_layout()
plt.show()
我的解决方案最终是将颜色条移到左侧。这是代码和输出:
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
PT = pd.DataFrame(np.random.randn(300, 3), columns=list('ABC'))
fig, (ax0, ax1) = plt.subplots(ncols=2, figsize=(10, len(PT) / 5.2), gridspec_kw={'width_ratios': [15, 15]})
sns.heatmap(PT.iloc[:, :-1], annot=False, cmap='RdYlGn', cbar_ax=ax0, ax=ax1)
for _, spine in ax1.spines.items():
spine.set_visible(True)
# second axis
asset_list = np.asarray(PT['C'])
ax3 = ax1.twinx()
ax3.set_ylim(ax1.get_ylim())
ax3.set_yticks(np.arange(len(PT)))
ax3.set_yticklabels(asset_list, fontsize=80)
# colorbar
ax0.tick_params(labelsize=80)
plt.tight_layout()
plt.show()