气泡图不显示元包 R 中的所有点

Question

我是编码新手，所以我希望我能提供所有必要的信息来回答这个问题！我正在使用 R 中的 meta 包进行元回归，并使用 bubble 函数对其进行绘制。我有 173 个点要绘制，但是，它只在图表上显示我的数据集中的 2 个点，我不确定为什么。

它说：

In bubble.metareg(m.gen.reg, studlab = TRUE, :
  Only first covariate in meta-regression ('population_density') considered in bubble plot. No regression line plotted.

我不确定那是什么意思，也没有找到显示我所有观点的方法。如果您知道该消息的含义或如何解决它，我将不胜感激。

Image of graph currently being produced

这是我的代码：

library(tidyverse)
library(dplyr)
library(meta)
library(stringr)
library(tidyr)

#took my large dataset and made it smaller to work with

small_dataset_2 <- read.csv("FirstRegressionData.csv",stringsAsFactors = F) %>%
  select(Author,Location,Date,value,Lower_Confidence_Limits, Upper_Confidence_Limits,Density_km2) %>%
  mutate(Stand_err =((Upper_Confidence_Limits - value)/1.96)) %>%
  na.omit("small_dataset_2")

#object used for meta analysis

m.gen <- metagen (TE = small_dataset$value,
                  seTE = Stand_err,
                  studlab = Location,
                  data = small_dataset,
                  comb.fixed = FALSE,
                  comb.random = TRUE,
                  overall.hetstat = TRUE,
                  method.tau = "REML")


population_density <- small_dataset_2$Density_km2
                  
m.gen.reg <- metareg(m.gen, ~population_density)  
m.gen.reg

bubble(m.gen.reg, 
       studlab = TRUE,
       xlim = c(1,500),
       ylim = c(0,18),
       regline = TRUE,
       xlab = ("x-axis"),
       ylab = ("y-axis"),
       col.line = "blue"
       )

谢谢！

Answer 1

欢迎光临！ meta 包状态的 instructions 关于您正在使用的气泡功能（bubble.metareg 在说明中）：

It is a scatter plot with the treatment effect for each study on the y-axis and the covariate used in the meta-regression.

我强调了来表示只识别了一个协变量。所以我的猜测是 metareg 没有为 bubble.

生成预期的对象

当您打印 m.gen.reg 时，它是否类似于 Doing Meta Analysis in R online book 的第 8.2 节中的以下内容？

此外，metagen 用于 small_dataset，未在任何地方定义。我反而看到 small_dataset_2.

气泡图不显示元包 R 中的所有点

Bubble plot not displaying all points in meta package R

meta

bubble-chart

regression

r