将多个文件的 .mhd 格式转换为 .nii 格式代码运行无误，但未完成转换

Question

我正在使用 sliver07 数据集，我的任务是 convert.mhd 将图像格式化为 .nii 格式。按照的回答，我能够将它转换为 1 张图像，但现在当我将它应用于多张图像时，它没有转换。

文件模块结构是这样的：

扫描
- file1.mhd
- file2.mhd

我的代码：

import glob
my_path='/content/drive/MyDrive/Datasets/sliver07/sliver07-training-scans/scan/'
files=glob.glob(my_path+'*.mhd')

# Scan from train
import SimpleITK as sitk
out = '/content/drive/MyDrive/Datasets/sliver07/sliver07-training-scans/trial/'

for i in range(len(files)):
        img = sitk.ReadImage(files[i]) 
        sitk.WriteImage(img, out + files[i] + '.nii')

但代码执行无误，但转换尚未完成。一定是哪里出了问题？

Answer 1

知道了！路径错误

# Scan from train
  import SimpleITK as sitk
   out = '/content/drive/MyDrive/Datasets/sliver07/sliver07-training-scans/trial/'

  for i in range(len(files)):
       img = sitk.ReadImage(files[i]) 
       sitk.WriteImage(img,  files[i].replace('.mhd','.nii'))

将多个文件的 .mhd 格式转换为 .nii 格式代码运行无误，但未完成转换

Conversion of .mhd format to .nii format for multiple files code runs without error, but no conversion done

python

loops

nifti

image-preprocessing

medical-imaging