在 pandas 中创建层次结构列

Question

我有这样一个数据框：

    part part_parent
0  part1         NaN
1  part2       part1
2  part3       part2
3  part4       part3
4  part5       part2

我需要像这样添加一个额外的列层次结构：

    part part_parent                hierarchy
0  part1         NaN                    part1
1  part2       part1             part1/part2/
2  part3       part2       part1/part2/part3/
3  part4       part3  part1/part2/part3/part4
4  part5       part2        part1/part2/part5

创建 input/output 数据帧的字典：

from numpy import nan

df1 = pd.DataFrame({'part': {0: 'part1', 1: 'part2', 2: 'part3', 3: 'part4', 4: 'part5'},
 'part_parent': {0: nan, 1: 'part1', 2: 'part2', 3: 'part3', 4: 'part2'}})


df2 = pd.DataFrame({'part': {0: 'part1', 1: 'part2', 2: 'part3', 3: 'part4', 4: 'part5'},
 'part_parent': {0: nan, 1: 'part1', 2: 'part2', 3: 'part3', 4: 'part2'},
 'hierarchy': {0: 'part1',
  1: 'part1/part2/',
  2: 'part1/part2/part3/',
  3: 'part1/part2/part3/part4',
  4: 'part1/part2/part5'}})

注意： 我已经看到几个与 NetworkX 相关的线程来解决这个问题，但我无法这样做。

感谢任何帮助。

Answer 1

这是一种递归的方法。它使用包含每个元素的 parent 的 Series 来查找给定的 parent 并返回到原始 parent 直到找到 NaN。此时它returns层次结构。

注意。如果你有一个循环网络或未定义的parents（后者可以很容易地被修复是需要的）

，这将不起作用

import pandas as pd

parents = df1.set_index('part')['part_parent']
def hierarchy(e):
    if not isinstance(e, list):
        return hierarchy([e])
    parent = parents[e[0]]
    if pd.isna(parent):
        return '/'.join(e)
    return hierarchy([parent]+e)

df2 = df1.copy()
df2['hierarchy'] = df1['part'].apply(hierarchy)

Answer 2

这是一个使用 networkx 的解决方案。它将nan作为根节点，并以此为基础找到到每个节点的最短路径。

import networkx as nx

def find_path(net, source, target):
    # Adjust this as needed (in case multiple paths are present)
    # or error handling in case a path doesn't exist
    path = nx.shortest_path(net, source, target)
    return "/".join(list(path)[1:])

net = nx.from_pandas_edgelist(df1, "part", "part_parent")
df1["hierarchy"] = [find_path(net, nan, node) for node in df1["part"]]

    part part_parent                hierarchy
0  part1         NaN                    part1
1  part2       part1              part1/part2
2  part3       part2        part1/part2/part3
3  part4       part3  part1/part2/part3/part4
4  part5       part2        part1/part2/part5

路径的格式是针对此示例设计的，如果需要更强大的错误处理或多路径格式，则必须调整路径查找器。

在 pandas 中创建层次结构列

Create hierarchy column in pandas

python

networkx

python-3.x

pandas