如何在闪亮服务器 R 应用程序的 docker 容器中设置 _auth0.yml 值

Question

仅供参考 - 对于闪亮的应用程序，我绝对是新手，但我正在尝试帮助闪亮的应用程序开发人员使用 docker 容器部署他们的应用程序（也是 docker 的新手但我已经完成了其中的一些，所以我明白发生了什么）。

我有一个闪亮的应用程序，部署在 docker 容器中的闪亮服务器上。这个闪亮的应用程序正在使用 auth0，我正在关注这篇文章 (https://github.com/curso-r/auth0)，以便 _auth0.yml 文件将从环境变量中获取它的秘密。

问题在于如何在 docker 容器中正确设置这些环境变量，以便我的 _auth0.yml 文件将填充它们的值？任何帮助将不胜感激！

我已经尝试在我的 Dockerfile 中设置“ENV”，

ENV AUTH0_USER="user" \
    AUTH0_KEY="key" \
    AUTH0_SECRET="secret"

如果我这样做，并将它放入我的 docker 容器中，我会看到环境变量已设置，但是当我运行应用程序时，环境变量不会填充“api_url”，并尝试转到“https://.auth0.com/authorize?client_id=&scope=openid%20profile&redirect_uri=http%3A%2F %2Flocalhost%3A3838&response_type=code&state=LmNvuzzUB8"

我的 Dockerfile 如下所示：

#shiny-more
FROM rocker/shiny-verse:latest

# install R packages required
RUN apt-get update -qq && apt-get install -y --no-install-recommends vim
RUN mkdir -p /opt/software/setup/R
ADD install_packages.R /opt/software/setup/R/
RUN Rscript /opt/software/setup/R/install_packages.R

#shiny-auth0
# copy the app to the image
COPY *.Rproj /srv/shiny-server/
COPY *.R /srv/shiny-server/
COPY *.xlsx /srv/shiny-server/data/
COPY *.png /srv/shiny-server/www/
COPY logs /srv/shiny-server/logs
COPY rsconnect /srv/shiny-server/rsconnect
COPY _auth0.yml /srv/shiny-server/

# select port
EXPOSE 3838 8080

# allow permission
RUN sudo chown -R shiny:shiny /srv/shiny-server

# Copy further configuration files into the Docker image
COPY shiny-server.sh /usr/bin/shiny-server.sh

RUN ["chmod", "+x", "/usr/bin/shiny-server.sh"]

ENV AUTH0_USER="user" \
    AUTH0_KEY="key" \
    AUTH0_SECRET="secret"

# run app
CMD ["/usr/bin/shiny-server.sh"]

我的 _auth0.yml 文件如下所示：

remote_url: ''
auth0_config:
  api_url: !expr paste0('https://', Sys.getenv("AUTH0_USER"), '.auth0.com')
  credentials:
    key: !expr Sys.getenv("AUTH0_KEY")
    secret: !expr Sys.getenv("AUTH0_SECRET")

编辑：我在这里读到 (https://groups.google.com/g/shiny-discuss/c/nNs0kztwdWo/m/90InjZXfAPEJ) 启动 R 时不会读取环境变量。那么怎么会这个解决方案真的有效吗？ https://github.com/curso-r/auth0

Answer 1

所以从技术上讲，我想出了解决这个问题的方法。我在项目的根目录下创建了一个“.Renviron”文件，将所有环境变量保存在该文件中，然后将其复制到我的 docker 图像中。

当我启动我的容器时，我能够成功地运行我的应用程序，使用 .Renviron 提供的数据，以便应用程序可以连接到 auth0 以验证用户。

现在我需要弄清楚如何将此文件传递给 docker 容器，以便安全地提取此 .Renviron 文件，而不必像 github.

如何在闪亮服务器 R 应用程序的 docker 容器中设置 _auth0.yml 值

How to set _auth0.yml values in a docker container for a shiny-server R app

r

docker

auth0