Shiny 中的 selectizeInput 和 checkboxInput 不兼容

Question

我正在创建一个应用程序，它从一个目录中获取一个文件并获取列名称，让用户有机会决定要使用哪个样本。

我没有上传文件，而是创建了一个数据框（类似于我的文件）并将其放入反应函数（这正是我上传文件时通常所做的）。

这是数据框

numbers <- c(5,345,55,10)
df<-data.frame(t(numbers))
names(df) <- c("S1", "S2", "S3", "S4")

> df
  S1  S2 S3 S4
1  5 345 55 10

我的应用程序有一个 checkboxInput，您可以决定是否要对数据框进行对数运算。

如果我想比较 S1 和 S2，我意识到当我不点击进入框（并且我不做对数）时，样本不会改变。这就是我想要的。

但是，如果我决定计算对数（我点击复选框）示例 2 会发生变化（现在它比较 S1 和 S1，我真的不知道明白为什么，我不想）。

这是代码：

library(shiny)

# Define UI 
ui <- fluidPage(

    # Application title
    titlePanel("My app"),


    sidebarLayout(
        sidebarPanel(
            uiOutput("selected_sample_one"),
            uiOutput("selected_sample_two"),
            checkboxInput("change_log2", "Log2 transformation", value = F),
            
        ),

        # Show a plot of the generated distribution
        mainPanel(
           plotOutput("plot")
        )
    )
)

# Define server 
server <- function(input, output,session) {

    data <- reactive({
        numbers <- c(5,345,55,10)
        df<-data.frame(t(numbers))
        names(df) <- c("S1", "S2", "S3", "S4")

        if(input$change_log2 == TRUE){
            df <- log2(df)
        }
        return(df)
    })
    
    
    samples_names <- reactive({
        samples <- colnames(data())
        return(samples)
    })
    
    
    output$selected_sample_one <- renderUI({
        selectizeInput(inputId = "sample_one_axis", "Select the 1st sample", choices=samples_names(), options=list(maxOptions = length(samples_names())))
    })
    
    # With this function you can select which sample do you want to plot in the y-axis.
    output$selected_sample_two <- renderUI({
        selectizeInput(inputId = "sample_two_axis", "Select the 2nd sample", choices=samples_names(), options=list(maxOptions = length(samples_names())))
    })
    
    output$plot <- renderPlot({
        barplot(c(data()[,input$sample_one_axis], data()[,input$sample_two_axis]))
    })
}

# Run the application 
shinyApp(ui = ui, server = server)

注：

如果我将列名保存到向量中，则对数和一切都有效。而不是使用

 samples_names <- reactive({
         samples <- colnames(data())
         return(samples)
     })

如果我使用：samples_names <- c("S1", "S2", "S3", "S4") 并使用这个新向量 samples_names 更改 output$selected_sample_one 和 output$selected_sample_two， 第二个样本不会更改（见新图）

但是，如果我增加列数或更改 table，此代码将不起作用。 因此，我将其写在反应函数...

有人知道怎么解决吗？

非常感谢

Answer 1

那是因为您的反应式数据框包含复选框信息，并且 sample_names 取决于该数据框。要将它们分开，请在执行日志操作的位置创建一个新数据框，使初始数据框不进行日志转换。试试这个

library(shiny)

# Define UI 
ui <- fluidPage(
  
  # Application title
  titlePanel("My app"),
  
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      uiOutput("selected_sample_one"),
      uiOutput("selected_sample_two"),
      checkboxInput("change_log2", "Log2 transformation", value = F)
    ),
    
    # Show a plot of the generated distribution
    mainPanel(
      plotOutput("plot")
    )
  )
)

# Define server 
server <- function(input, output,session) {
  
  data <- reactive({
    
    numbers <- c(5,345,55,10)
    df<-data.frame(t(numbers))
    names(df) <- c("S1", "S2", "S3", "S4")
    
    return(df)
  })
  
  data1 <- eventReactive(input$change_log2,{
    df <- data()
    if(input$change_log2 == TRUE){
      df <- log2(df)
    }
    return(df)
  })
  
  samples_names <- reactive({
    req(data())
    samples <- colnames(data())
    return(samples)
  })
  
  output$selected_sample_one <- renderUI({
    selectizeInput(inputId = "sample_one_axis", "Select the 1st sample", choices=samples_names(), options=list(maxOptions = length(samples_names())))
  })
  
  # With this function you can select which sample do you want to plot in the y-axis.
  output$selected_sample_two <- renderUI({
    selectizeInput(inputId = "sample_two_axis", "Select the 2nd sample", choices=samples_names(), selected=samples_names()[2], options=list(maxOptions = length(samples_names())))
  })
  
  output$plot <- renderPlot({
    req(input$sample_one_axis,input$sample_two_axis,data1())
    barplot(c(data1()[,input$sample_one_axis], data1()[,input$sample_two_axis]))
  })
}

# Run the application 
shinyApp(ui = ui, server = server)

Shiny 中的 selectizeInput 和 checkboxInput 不兼容

Incompatibility between selectizeInput and checkboxInput in Shiny

r

shiny

selectinput