查找列中特定值的最大值？

Question

我有一个包含 34 列和 12,964 行的数据框，其中两列是 Gene.Name 和 Mutation_Frequency。例如：

Gene.Name	Mutation_Frequency
CTLA4	0
TP53	4
CTLA4	2
CTLA4	2
TP53	4
TP53	6

我现在想创建一个名为“Highest_Mutation_Frequency”的列，它告诉我 Gene.Name 的最高突变频率，并将其放在一个新列中，如下所示：

Gene.Name	Mutation_Frequency	最高_Mutation_Frequency
CTLA4	0	2
TP53	4	6
CTLA4	2	2
CTLA4	2	2
TP53	0	6
TP53	6	6

我意识到我可能会使用 max() 命令，但我不确定如何实现它。一如既往，我们将不胜感激！

编辑：尽管这与另一个问题非常相似： Select the row with the maximum value in each group 这个问题还涉及生成唯一行并将它们放在另一个数据框中。

Answer 1

您可以使用：

library(dplyr)

data %>%
  group_by(Gene.Name) %>%
  mutate(Highest_Mutation_Frequency = max(Mutation_Frequency))

Answer 2

选项base R

aggregate(cbind(Highest_Mutation_Frequency = Mutation_Frequency) ~ Gene.Name, data, FUN = max)

Answer 3

另一个基础 R 选项使用 unique + ave

unique(
  transform(
    df,
    Highest_Mutation_Frequency = ave(Mutation_Frequency,Gene.Name,FUN = max)
  )[c("Gene.Name","Highest_Mutation_Frequency")]
)

查找列中特定值的最大值？

Find the maximum value for a specific value in a column?

r

dataframe

max