如何将多fasta文件头转换为单fasta文件头？
How to convert the multi fasta file header into single fasta header?
我有一个 multifasta 文件，如下所示
>t_xth_1
MNGTGHA
>t_xth_1
MNGTGHA
>ocean
MNGTGHA
>ocean
MNGTGHA
>sea
MNGTGHA
我需要将上面的 fasta 文件转换为下面显示的文件格式（预期输出），
>t_xth_1
MNGTGHA
MNGTGHA
>ocean
MNGTGHA
MNGTGHA
>sea
MNGTGHA
请帮我做同样的事情。
谢谢。
如果awk是一个选项
$ awk '/^>/ {if ([=10=] == prev) next; prev = [=10=]} 1' file
>t_xth_1
MNGTGHA
MNGTGHA
>ocean
MNGTGHA
MNGTGHA
>sea
MNGTGHA
在匹配正则表达式 ^> 的记录上：如果当前记录与 prev 变量相同，则转到下一条记录，否则更新 prev。尾随 1 将 print 当前记录。
我有一个 multifasta 文件，如下所示
>t_xth_1
MNGTGHA
>t_xth_1
MNGTGHA
>ocean
MNGTGHA
>ocean
MNGTGHA
>sea
MNGTGHA
我需要将上面的 fasta 文件转换为下面显示的文件格式（预期输出），
>t_xth_1
MNGTGHA
MNGTGHA
>ocean
MNGTGHA
MNGTGHA
>sea
MNGTGHA
请帮我做同样的事情。
谢谢。
如果awk是一个选项
$ awk '/^>/ {if ([=10=] == prev) next; prev = [=10=]} 1' file
>t_xth_1
MNGTGHA
MNGTGHA
>ocean
MNGTGHA
MNGTGHA
>sea
MNGTGHA
在匹配正则表达式 ^> 的记录上：如果当前记录与 prev 变量相同，则转到下一条记录，否则更新 prev。尾随 1 将 print 当前记录。