如何在 UNIX/LINUX 中特定行的末尾添加字符？

Question

这是我的输入文件。我想在行首有“>”的行末尾添加一个字符“：”。我试过 seq -i 's|$|:|' input.txt 但“：”被添加到每行的所有结尾。也很难调出特定的行号，因为在我的每个输入文件中，该行包含“>”，出现在不同的行号中。我想运行多个文件的循环所以它没用。

>Pas_pyrG_2
AAAGTCACAATGGTTAAAATGGATCCTTATATTAATGTCGATCCAGGGACAATGAGCCCA
TTCCAGCATGGTGAAGTTTTTGTTACCGAAGATGGTGCAGAAACAGATCTGGATCTGGGT
>Pas_rpoB_4
CAAACTCACTATGGTCGTGTTTGTCCAATTGAAACTCCTGAAGGTCCAAACATTGGTTTG
ATCAACTCGCTTTCTGTATACGCAAAAGCGAATGACTTCGGTTTCTTGGAAACTCCATAC
CGCAAAGTTGTAGATGGTCGTGTAACTGATGATGTTGAATATTTATCTGCAATTGAAGAA
>Pas_cpn60_2
ATGAACCCAATGGATTTAAAACGCGGTATCGACATTGCAGTAAAAACTGTAGTTGAAAAT
ATCCGTTCTATTGCTAAACCAGCTGATGATTTCAAAGCAATTGAACAAGTAGGTTCAATC
TCTGCTAACTCTGATACTACTGTTGGTAAACTTATTGCTCAAGCAATGGAAAAAGTAGGT
AAAGAAGGCGTAATCACTGTAGAAGAAGGCTCAGGCTTCGAAGACGCATTAGACGTTGTA

这是专业的输出文件：

    >Pas_pyrG_2:
    AAAGTCACAATGGTTAAAATGGATCCTTATATTAATGTCGATCCAGGGACAATGAGCCCA
    TTCCAGCATGGTGAAGTTTTTGTTACCGAAGATGGTGCAGAAACAGATCTGGATCTGGGT
    >Pas_rpoB_4:
    CAAACTCACTATGGTCGTGTTTGTCCAATTGAAACTCCTGAAGGTCCAAACATTGGTTTG
    ATCAACTCGCTTTCTGTATACGCAAAAGCGAATGACTTCGGTTTCTTGGAAACTCCATAC
    CGCAAAGTTGTAGATGGTCGTGTAACTGATGATGTTGAATATTTATCTGCAATTGAAGAA
    >Pas_cpn60_2:
    ATGAACCCAATGGATTTAAAACGCGGTATCGACATTGCAGTAAAAACTGTAGTTGAAAAT
    ATCCGTTCTATTGCTAAACCAGCTGATGATTTCAAAGCAATTGAACAAGTAGGTTCAATC
    TCTGCTAACTCTGATACTACTGTTGGTAAACTTATTGCTCAAGCAATGGAAAAAGTAGGT
    AAAGAAGGCGTAATCACTGTAGAAGAAGGCTCAGGCTTCGAAGACGCATTAGACGTTGTA

seq是否有更多选项可以修改或其他命令可以解决这个问题？

Answer 1

使用ed编辑文件：

printf "%s\n" 'g/^>/s/$/:/' w | ed -s input.txt

对于以 > 开头的每一行，在末尾添加一个冒号，然后 w 将更改的文件写回磁盘。

Answer 2

sed -i  '/^>/ s/$/:/' input.txt

在输入行中搜索匹配 ^> 的行（“以 > 字符开头的正则表达式）。那些 s 替换 : 表示行尾（你做对了这部分）。

/ 斜杠是 sed 中的标准分隔符。如果你想使用不同的字符，一定要传递 -e 或 s|$|:| 可能不会起作用。由于 / 个字符与 | 个字符不同，它们在 shell 中是没有意义的字符，所以最好使用它们，除非模式还包含斜杠，在这种情况下事情会变得笨拙。

小心sed -i。进行备份 - 使用 diff 比较文件，确保您知道发生了什么变化。

On OSX -i 需要参数。

如何在 UNIX/LINUX 中特定行的末尾添加字符？

How to add character at the end of specific line in UNIX/LINUX?

unix

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add

seq