Cytoscape - 已安装但未显示的应用程序

Cytoscape - apps installed but not showing

我已经成功安装了 Cytoscape。

Version: 3.8.2 
Java: 11.0.6 by AdoptOpenJDK 
Java Home: /Applications/Cytoscape_v3.8.2/.install4j/jre.bundle/Contents/Home 
OS: Mac OS X 10.15.6 - x86_64

我已经成功安装了几个应用程序。

但是,只有 JGF App 一个应用程序显示在应用程序下拉菜单中,none 个其他应用程序显示 present/active。例如,gexf-app 应该允许 Cytoscape 导入该文件格式,但 'File/Open' 或 'File Import' 都无法识别文件类型。

阅读文档后,许多文件类型都支持(似乎)导入。但是我没有成功导入文件,这可以说是目前对我来说最重要的文件。

我怎样才能让安装的应用程序正常工作,或者什么可能会阻止它们这样做?

注意:我这个未回答的 stackexchange question 似乎是相关的。

很抱歉听到您的问题。我的猜测是您安装的其中一个应用程序在启动时崩溃并阻止其他应用程序启动。我将从禁用“JGF App”和“gexf-app”开始,看看其他应用程序是否都出现了。查看应用程序列表,您不会在应用程序菜单中看到它们——在工具菜单中查看“合并”和“分析网络”。然后,您可以启用 gexf-app 并查看它是否启动(如果没有启动,您应该会在 Cytoscape 的左下角看到一个指示器)。如果你点击它,它会给你更多关于发生的事情的信息。如果启动正常,您可以尝试启用“JGF App”。

-- 滑板车