将绘图与 grid.arrange 组合并调整绘图大小和轴标签

Question

我想将两个 ggplots 和 grid.arrange 合并为一个通用图例。我设法用一个小技巧将两个图例结合起来，但由于我从第一个图中删除了图例，所以这个图例在 grid.arrange 之后当然更宽泛。如何使两个绘图区域的大小相同？而且我还希望有一个共同的 x 轴标签在两个图的下方居中。 grid.arrange 可以吗？我知道，之前已经回答过类似的问题，但我仍然是 R 的新手，解决方案太复杂或者我无法将它们适合我的数据。

这是我的两个数据集：

testxy
  SN strain     est     low      up
1  A     xy 11.6751 11.1480 12.2021
2  B     xy 11.4211 11.1108 11.7314
3  C     xy  2.6603  2.4291  2.8915
4  D     xy  4.5503  4.2972  4.8034

testyz
  SN strain     est     low      up
5  A     yz 22.1761 21.5136 22.8387
6  C     yz 21.4829 21.0251 21.9408
7  B     yz 19.3294 18.8950 19.7639
8  D     yz 19.9990 19.3934 20.6047

这是我目前的代码。它接近我想要的，但只是接近：

p1<-ggplot(data=testxy, aes(colour=strain, x=SN, y=est))+
theme(panel.background = element_rect(fill = 'white', colour = 'black'))+
theme(legend.position="none")+
theme(axis.title.x = element_text(size = rel(1.5), vjust=-0.1), 
axis.title.y = element_text(size = rel(1.5), vjust=1), axis.text.y = element_text(size = rel(1.4)), axis.text.x = element_text(hjust = 1, size = rel(1.5)),plot.title = element_text(size = rel(2.5), lineheight=1, face="bold"))+
      theme(plot.margin=unit(c(5,5,5,5),"mm"))+
      labs(x="treatment", y="integral", title="xy")+
      scale_colour_manual(name="strain", values=c(xy="blue"))+
      theme(strip.text.x = element_text(size=12, face="bold"), strip.background = element_rect(colour="black", fill="white"))+
      geom_point(aes(color="xy"), size=5, alpha=0.1, shape=16)+
      geom_errorbar(aes(ymin=low, ymax=up, width=0.2), colour="deepskyblue", size=0.8)+
      scale_y_continuous(breaks=seq(5,20,5), limits=c(2,23.5))

p2<-ggplot(data=testyz, aes(colour=strain, x=SN, y=est))+
  theme(panel.background = element_rect(fill = 'white', colour = 'black'))+
  theme(legend.position="right")+
  theme(axis.title.x = element_text(size = rel(1.5), vjust=-0.1), axis.ticks.y = element_blank(), axis.text.y = element_blank(), axis.text.x = element_text(hjust = 1, size = rel(1.5)), plot.title = element_text(size = rel(2.5), lineheight=1, face="bold"))+
  theme(plot.margin=unit(c(5,5,5,5),"mm"))+
  labs(x="treatment", y=NULL, title="yz")+
  scale_colour_manual(name="strain", values=c(yz="green", xy="blue"))+
  theme(strip.text.x = element_text(size=12, face="bold"), strip.background = element_rect(colour="black", fill="white"))+
  geom_point(aes(color="yz"), size=5, alpha=0.1, shape=16)+
  geom_point(aes(color="xy"), size=0)+
  geom_errorbar(aes(ymin=low, ymax=up, width=0.2), colour="green", size=0.8)+
  scale_y_continuous(breaks=seq(5,20,5), limits=c(2,23.5))+
  scale_x_discrete(limits=c("A", "C", "B", "D"))

grid.arrange(p1,p2, ncol=2)

我之前试过分面。看起来确实不错，但不幸的是，我需要更改 levels 在 x 轴上的顺序。所以，我认为分面不适合我。

希望你能帮助我。

干杯安妮

Answer 1

如果分面的唯一问题是级别的顺序，可以通过在调用 ggplot2 之前重新排序因子变量来解决。

您可以在转换为因子时指定因子水平的顺序。

df = rbind(testxy, testyz)
df$strain <- factor(as.character(df$strain), levels=c('yz','xy'))
ggplot(df, aes(colour=strain, x=SN, y=est))+facet_grid(.~strain)

Answer 2

你应该使用分面：

testxy <- read.table(text = "  SN strain     est     low      up
1  A     xy 11.6751 11.1480 12.2021
2  B     xy 11.4211 11.1108 11.7314
3  C     xy  2.6603  2.4291  2.8915
4  D     xy  4.5503  4.2972  4.8034", header = TRUE)

testyz <- read.table(text = "   SN strain     est     low      up
5  A     yz 22.1761 21.5136 22.8387
6  C     yz 21.4829 21.0251 21.9408
7  B     yz 19.3294 18.8950 19.7639
8  D     yz 19.9990 19.3934 20.6047", header = TRUE)

test <- rbind(cbind(testxy, fac = "xy"),
              cbind(testyz, fac = "yz"))


test$SN1 <- interaction(test$SN, test$fac)
test$SN1 <- ordered(test$SN1, levels = test$SN1)


ggplot(data=test, aes(colour=strain, x=SN1, y=est)) +
  geom_point() + 
  facet_wrap(~ fac, scales = "free_x") +
  scale_x_discrete(labels = setNames(as.character(test$SN), as.character(test$SN1)))

然而，这不是一个好的情节，因为 reader 通常不会注意到 x 轴的不同。

将绘图与 grid.arrange 组合并调整绘图大小和轴标签

Combine plots with grid.arrange and adjust plot size and axis label

r

ggplot2

axis

legend