R terra - 将数组分配给不包含所有单元格值的 SpatRaster 对象的最有效方法

R terra - most efficient way to assign an array to a SpatRaster object that does NOT contain all cell values

假设我们有一个数组 modeldata(数据来自地面模型),其维度为:

> dim(modeldata)
[1] 67420   518

第一个维度包括网格的单元格,第二个维度是来自 1500:2017
的时间序列 第一维的不寻常长度是由于单独存在地球细胞来保存space.

raster 包中,我按以下方式处理它:

> coords
        [,1]   [,2]
[1,] -179.75 -16.25
[2,] -179.75  65.25
[3,] -179.75  65.75
[4,] -179.75  66.25
[...,]  ...     ...
[67420,] 179.75  71.25

> wgs84 <- sp::CRS("+proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +no_defs")
> modeldata_spdf <- sp::SpatialPixelsDataFrame(coords,
                                               data = data.frame(modeldata),
                                               proj4string = wgs84)

> modeldata_brick <- raster::brick(modeldata_spdf)

请不要这样评价我,
我对使用 terra 包的可比(性能)方法更感兴趣。
另一种也很好的方法是使用 SpatRaster 遮罩层而不是坐标。

谢谢 :-)

下面的方法适用于在已知规则栅格上计算位置子集(感兴趣的像元)的值的情况。对于其他情况,请参阅 values<-rast(, xyz=TRUE)rasterize

示例数据

library(terra)
r <- rast(res=10)
set.seed(0)
cells <- sample(ncell(r), 5)
xy <- xyFromCell(r, cells)
xy
#        x   y
#[1,] -165 -25
#[2,]   25  55
#[3,] -135 -55
#[4,] -155 -45
#[5,]  -75   5

在这种情况下,我们有 5 个位置,下面的模型数据 md 有 2 个时间步长(层),每个时间步(层)有 5 个值

md <- cbind(A=1:5, B=5:1)

# compute cell numbers (not needed here as we have them already)
cells <- cellFromXY(r, xy)

# create empty raster
x <- rast(r, nlyr=2)

# assign values
x[cells] <- md

在您的情况下,保留单元格编号而不是坐标可能更有效。

以上内容稍作修改后也适用于 raster