如何读取 hdf5 文件。并将它们绘制为图像

Question

我有这个 hdf5 格式的月球陨石坑数据集 https://zenodo.org/record/1133969/files/train_craters.hdf5?download=1 但我不知道如何阅读它们并查看此数据集中的图像

Answer 1

对于 Reading a HDF5 file 部分，我认为这是一个重复的问题，来自 post ：

对于绘图部分，我建议您查看 matplotlib pyplot 文档并深入了解其工作原理

文档：https://matplotlib.org/stable/api/_as_gen/matplotlib.pyplot.html

教程：https://matplotlib.org/stable/tutorials/introductory/pyplot.html

Answer 2

HDF5 是组织成组和数据集（也称为数据模式）的任意数据的容器。要有效地处理数据，您需要在开始编码之前了解模式。理想情况下，数据源提供模式。如果没有，您的第一步是推导模式。您可以通过打开文件并使用 HDFView（来自 HDF Group）查看，或编写链接答案中所示的小代码片段来执行此操作。

我看了你的档案。你说你想“看图像”。你不能用这些数据做到这一点。我在这里阅读了文件描述：DeepMoon Supplemental Materials。有 6 个感兴趣的文件：

name_craters.hdf5 - Pandas 数据集中图像的陨石坑位置和大小的 HDFStore。
name_images.hdf5 - 数据集的输入 DEM 图像和输出目标，其中：
- name = dev 用于验证数据集
- name = test for the test dataset
- name = train 用于训练数据集

因此，如果您需要训练图像数据，则需要下载 train_images.hdf5 文件。警告：它是 9.9 GB。

关于 train_craters.hdf5 文件的评论：
此文件由 Pandas 创建。该文件有 30_000 个组，每个图像 1 个（名为“img_xxxxx”）。每组有 4 个数据集，分别命名为：“axis_0”、“axis_1”、“block0_items”和“block0_values”。他们有关于每个图像的数据，但没有任何图像数据。例如，“axis_0”和“block0_items”都有以下条目：

Diameter (km)
Lat
Long
x
y
Diameter (pix)

“block0_values”中有数据。这是来自“img_00000/block0_values”的示例：

[[ 5.32341731 -35.10135397 -101.80962272 161.77188631 252.6564721 10.87213217]  
 [ 5.38713978 -34.86402264 -102.38375512 132.62561605 237.8560143 11.00227398]]

从这里你得到：

Diameter (km)[0] = 5.32341731
Lat[0] = -35.10135397
Long[0] = -101.80962272
x[0] = 161.77188631
y[0] = 252.6564721
Diameter (pix)[0] = 10.87213217

Diameter (km)[1] = 5.38713978
Lat[1] = -34.86402264
Long[1] = -102.38375512
x[1] = 132.62561605
y[1] = 237.8560143
Diameter (pix)[1] = 11.00227398

因此，这提供了关于每个图像的一些基本信息...但不是可以转换为图像的像素值数组。

如何读取 hdf5 文件。并将它们绘制为图像

How can I read hdf5 files. and plot them as images

python

hdf5

dataset