如何使用 Python 从 RDFLib 读取 URI？

Question

我有几千个 URIRef ontology 值，我正在尝试获取以下字符串表示形式：

[rdflib.term.URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002219'),
 rdflib.term.URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002551'),
rdflib.term.URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/uberon/core#indirectly_supplies')]

我可以单独去每个人的link（例如http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002219）并得到它（例如surrounded by），但是我怎么能用Python呢？我有两种方法可以看到如何做到这一点，但我也无法弄清楚。一种方法是简单地使用 RDFLib 库，但我没有找到翻译 link 的函数。另一种方法是解析 HTML link 以获得红色值（我认为这与翻译相对应）。

请注意，其中一些没有附加任何内容（例如 http://purl.obolibrary.org/obo/uberon/core#indirectly_supplies 是 404: Not Found）

Answer 1

由于这些 URI 支持 RDF 内容协商，您只需获取 rdf 并将其加载到图中，如下所示。获得图表后，您可以使用 SPARQL 查询您想要的属性。在下面的示例中，我获取了每个主题的标签。我还删除了您提供的一个 URI，因为它是 404。

from rdflib import Graph, URIRef

uris = [URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002219'), URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002551')]

for uri in uris:
   query = """
   SELECT ?label WHERE {
      <"""+str(uri)+"""> rdfs:label ?label.
   }
   """
   g = Graph()
   g.parse(uri)
   res = g.query(query)
   for result in res:
      print(result)

这给出了一个输出，

(rdflib.term.Literal('surrounded by', lang='en'),)
(rdflib.term.Literal('has skeleton'),)

如何使用 Python 从 RDFLib 读取 URI？

How to read URIs from RDFLib using Python?

python

uri

html-parsing

rdf

ontology