有没有办法在 Pandas 数据帧中建立 neo4j 的关系？

Question

我已经使用 py2neo 包创建了节点

from py2neo import Graph
from py2neo import Node

这是我的 pandas 数据框

我可以成功创建节点。

我一直在尝试处理关系出错！

graph.create(Relationship(pmid, "Having_author", auth))

TypeError：不支持类型的值

我也提到了堆栈溢出问题，但仍然出现错误！

有没有其他方法可以与 pandas 数据框建立关系？

Answer 1

您的代码失败，因为节点的 ID 必须是文字（整数或字符串），但是您在编写 ...id = data['PMID']) 时将 ID 设置为系列。看起来 py2neo 允许您创建具有错误 ID 的节点对象，但实际上不应该，因为由于 ID 错误，与该节点的所有关系都将失败。

用一个整数作为 ID 重新创建节点类，然后应该可以毫无问题地创建它们之间的关系。

请注意，我还没有测试过这段代码，但这是您循环遍历 df 并创建节点的方式。

for i, row in data.iterrows():
    pmid = row['PMID'] #this is the integer PMID based on your df
    pmi_node = Node("PMID row " + str(i), id=pmid) #create node

    authid = row['AU'] #this is a string author name based on your df
    auth_node = Node("Auth row " + str(i), id=authid) #create node

    graph.create(pmi_node | auth_node)

    #create a relationship between the PMI and Auth for that row
    graph.create(Relationship(pmi_node , "Having_author", auth_node))

PS -- 您引用的 SO link 没有使用 py2neo 包，而是简单地使用 neo4j 将密码字符串发送到数据库python 包。如果您是初学者，我会推荐这条路线。

Answer 2

我在 zip 中转换了系列对象，然后它对我有用

for pmid, au in tqdm(zip(data.PMID, data.AU),total = data.shape[0]):
    pmid_node = Node("pmid", name=int(pmid))
    au_node = Node("author", name=au)
    graph.create(Relationship(pmid_node, "HAVING_AUTHOR", au_node))

有没有办法在 Pandas 数据帧中建立 neo4j 的关系？

Is there any way to make relationship of neo4j in Pandas dataframe?

relationship

neo4j

dataframe

python-3.x

pandas