匹配字符串模式 - 通过 awk-gsub 替换为另一个模式
Match string pattern - Replacement via awk-gsub with another pattern
AIM
- 我希望能够匹配字符串中的模式,这使用它的初始和最终边界。
- 我进一步打算用“ID=”替换模式。
字符串
Class=Grainyhead.domain.factors;Family=CP2-related.factors;id=TFCP2.Ca9750.2.YY2017.HT-SE2;strand=+;seq=TTCTGGTTGGGACCAGGA;score=7.62921;pval=6.53e-05;Averageconservationscore=1.77
希望与 AWK 中的命令匹配的字符串模式
模式
Class=Grainyhead.domain.factors;Family=CP2-related.factors;id=
命令
(/\Class=(.*);id=/)
AWK-GSUB
awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {gsub(/\Class=(.*);id=/), "ID=", ) 1'}
我不确定 (.*) 使用 !
我通常在 R 中将它用于字符串的 select 部分。
这也可以用于 awk-gsub 过滤吗?
您的分隔符看起来像“;
”(不是制表符)。
要使用“以标记开始”进行过滤,请在正则表达式的开头使用“^
”(而非\
)。
第一次替换后,select 列为 $
number。
cat file | awk 'BEGIN{FS=OFS=";"} {gsub(/^Class=(.*);id=/, "id="); print , }' > outputfile
AIM
- 我希望能够匹配字符串中的模式,这使用它的初始和最终边界。
- 我进一步打算用“ID=”替换模式。
字符串
Class=Grainyhead.domain.factors;Family=CP2-related.factors;id=TFCP2.Ca9750.2.YY2017.HT-SE2;strand=+;seq=TTCTGGTTGGGACCAGGA;score=7.62921;pval=6.53e-05;Averageconservationscore=1.77
希望与 AWK 中的命令匹配的字符串模式
模式
Class=Grainyhead.domain.factors;Family=CP2-related.factors;id=
命令
(/\Class=(.*);id=/)
AWK-GSUB
awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {gsub(/\Class=(.*);id=/), "ID=", ) 1'}
我不确定 (.*) 使用 !
我通常在 R 中将它用于字符串的 select 部分。
这也可以用于 awk-gsub 过滤吗?
您的分隔符看起来像“;
”(不是制表符)。
要使用“以标记开始”进行过滤,请在正则表达式的开头使用“^
”(而非\
)。
第一次替换后,select 列为 $
number。
cat file | awk 'BEGIN{FS=OFS=";"} {gsub(/^Class=(.*);id=/, "id="); print , }' > outputfile