与“未来”并行的 GIS

Question

我注意到在 raster 之后加载 furrr 时，我被警告说 values 被屏蔽了：

The following object is masked from ‘package:raster’:

    values

我不是 100% 确信这是问题所在，但我正在努力运行 raster::extract sf 个对象

library(raster)
library(sf)
p <- shapefile(system.file("external/lux.shp", package="raster"))
s <- as(p, "sf")
r <- raster(p, ncol=100, nrow=100)
values(r) <- 1:ncell(r)

我可以很好地提取

raster::extract(r, s)

但是当我并行化（版本 1）时出现错误：

library(furrr)
plan(strategy = "multiprocess", workers =2)

future_map(1:2, function(extr){
  raster::extract(r,s)
})

一件奇怪的事情是它似乎可以与 sp 类型的对象（版本 2）

一起工作

u<-as(s, "Spatial")

future_map(1:2, function(extr){
  raster::extract(r,u)
})

除了在 sf 和 SpatialPointsDataFrame 之间切换之外，我怎样才能让“版本 1”代码正常工作？

Answer 1

工作人员没有加载 sf 包裹。使用 .options = furrr_options(packages = "sf").

重现问题：

future_map(1:2, function(x){
  raster::extract(r,s)
})
#> Error in as(from, "Spatial"): no method or default for coercing "sf" to "Spatial"

解决方案：

future_map(1:2, .options = furrr_options(packages = "sf"), function(x){
  raster::extract(r,s)
})

与“未来”并行的 GIS

Parallel GIS with `future`

gis

r

r-raster

sf

furrr

重现问题：

解决方案：