如何使用 groupby 并应用到 polars
How to use groupby and apply with polars
我正在绞尽脑汁想弄清楚如何在 Python 的库 polars 中使用 groupby
和 apply
。
来自 Pandas,我正在使用:
def get_score(df):
return spearmanr(df["prediction"], df["target"]).correlation
correlations = df.groupby("era").apply(get_score)
但在极地,这不起作用。
我尝试了几种方法,主要围绕:
correlations = df.groupby("era").apply(get_score)
但这失败并显示错误消息:
'Could net get DataFrame attribute '_df'. Make sure that you return a DataFrame object.: PyErr { type: <class 'AttributeError'>, value: AttributeError("'numpy.float64' object has no attribute '_df'"),
有什么想法吗?
从 polars>=0.10.4
开始,您可以使用 pl.spearman_rank_corr
函数。
如果你想使用自定义函数,你可以这样做:
多个自定义函数 columns/expressions
import polars as pl
from typing import List
from scipy import stats
df = pl.DataFrame({
"g": [1, 1, 1, 2, 2, 2, 5],
"a": [2, 4, 5, 190, 1, 4, 1],
"b": [1, 3, 2, 1, 43, 3, 1]
})
def get_score(args: List[pl.Series]) -> pl.Series:
return pl.Series([stats.spearmanr(args[0], args[1]).correlation], dtype=pl.Float64)
(df.groupby("g", maintain_order=True)
.agg(
pl.apply(
exprs=["a", "b"],
f=get_score).alias("corr")
))
Polars 提供的功能
(df.groupby("g", maintain_order=True)
.agg(
pl.spearman_rank_corr("a", "b").alias("corr")
))
两者输出:
shape: (3, 2)
┌─────┬──────┐
│ g ┆ corr │
│ --- ┆ --- │
│ i64 ┆ f64 │
╞═════╪══════╡
│ 1 ┆ 0.5 │
├╌╌╌╌╌┼╌╌╌╌╌╌┤
│ 2 ┆ -1e0 │
├╌╌╌╌╌┼╌╌╌╌╌╌┤
│ 5 ┆ NaN │
└─────┴──────┘
单个 column/expression
上的自定义函数
我们还可以通过 .apply
或 .map
对单个表达式应用自定义函数。
下面是一个示例,说明我们如何使用自定义函数和普通极坐标表达式对列进行平方。表达式语法
应该始终是首选,因为它要快得多。
(df.groupby("g")
.agg(
pl.col("a").apply(lambda group: group**2).alias("squared1"),
(pl.col("a")**2).alias("squared2")
))
apply
和 map
有什么区别?
map
适用于整列 series
。 apply
适用于单个值或单个组,具体取决于上下文。
select
上下文:
map
- input/output 类型:
Series
- 输入的语义:一列值
apply
- input/output 类型:
Union[int, float, str, bool]
- 输入的语义:列中的单个值
groupby
上下文:
map
- input/output 类型:
Series
- 输入的语义含义:值为组的列表列
apply
- input/output 类型:
Series
- 输入的语义:组
我正在绞尽脑汁想弄清楚如何在 Python 的库 polars 中使用 groupby
和 apply
。
来自 Pandas,我正在使用:
def get_score(df):
return spearmanr(df["prediction"], df["target"]).correlation
correlations = df.groupby("era").apply(get_score)
但在极地,这不起作用。
我尝试了几种方法,主要围绕:
correlations = df.groupby("era").apply(get_score)
但这失败并显示错误消息:
'Could net get DataFrame attribute '_df'. Make sure that you return a DataFrame object.: PyErr { type: <class 'AttributeError'>, value: AttributeError("'numpy.float64' object has no attribute '_df'"),
有什么想法吗?
从 polars>=0.10.4
开始,您可以使用 pl.spearman_rank_corr
函数。
如果你想使用自定义函数,你可以这样做:
多个自定义函数 columns/expressions
import polars as pl
from typing import List
from scipy import stats
df = pl.DataFrame({
"g": [1, 1, 1, 2, 2, 2, 5],
"a": [2, 4, 5, 190, 1, 4, 1],
"b": [1, 3, 2, 1, 43, 3, 1]
})
def get_score(args: List[pl.Series]) -> pl.Series:
return pl.Series([stats.spearmanr(args[0], args[1]).correlation], dtype=pl.Float64)
(df.groupby("g", maintain_order=True)
.agg(
pl.apply(
exprs=["a", "b"],
f=get_score).alias("corr")
))
Polars 提供的功能
(df.groupby("g", maintain_order=True)
.agg(
pl.spearman_rank_corr("a", "b").alias("corr")
))
两者输出:
shape: (3, 2)
┌─────┬──────┐
│ g ┆ corr │
│ --- ┆ --- │
│ i64 ┆ f64 │
╞═════╪══════╡
│ 1 ┆ 0.5 │
├╌╌╌╌╌┼╌╌╌╌╌╌┤
│ 2 ┆ -1e0 │
├╌╌╌╌╌┼╌╌╌╌╌╌┤
│ 5 ┆ NaN │
└─────┴──────┘
单个 column/expression
上的自定义函数我们还可以通过 .apply
或 .map
对单个表达式应用自定义函数。
下面是一个示例,说明我们如何使用自定义函数和普通极坐标表达式对列进行平方。表达式语法 应该始终是首选,因为它要快得多。
(df.groupby("g")
.agg(
pl.col("a").apply(lambda group: group**2).alias("squared1"),
(pl.col("a")**2).alias("squared2")
))
apply
和 map
有什么区别?
map
适用于整列 series
。 apply
适用于单个值或单个组,具体取决于上下文。
select
上下文:
map
- input/output 类型:
Series
- 输入的语义:一列值
- input/output 类型:
apply
- input/output 类型:
Union[int, float, str, bool]
- 输入的语义:列中的单个值
- input/output 类型:
groupby
上下文:
map
- input/output 类型:
Series
- 输入的语义含义:值为组的列表列
- input/output 类型:
apply
- input/output 类型:
Series
- 输入的语义:组
- input/output 类型: