为每个用户设置 R 使用的 libblas 和 liblapack（不是 global/systemwide）Debian Linux 10

Question

我可以为我的系统设置默认值 BLAS/LAPACK，随后由 R 使用：

sudo update-alternatives --config libblas.so.3-x86_64-linux-gnu
sudo update-alternatives --config liblapack.so.3-x86_64-linux-gnu

更新用于所有用户的 BLAS/LAPACK。我想选择 BLAS/LAPACK 而不影响所有其他用户在 R 中的 BLAS/LAPACK 用法。

我也尝试将 .bashrc 中的 $LD_LIBRARY_PATH 更改为：

LD_LIBRARY_PATH="/usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas:$LD_LIBRARY_PATH"; export LD_LIBRARY_PATH

无需更改（即使在注销并再次登录后）R 使用的默认 BLAS/LAPACK（由 sessionInfo() 检查）。

用户的单独 VM 可以工作，也许 Docker，但我希望有一个更简单的解决方案。

Answer 1

简而言之，我用R's flexiblast library, itself a wrapper around flexiblas来表示每个用户使用哪个BLAS/LAPACK。将系统范围的 BLAS/LAPACK 更改为 flexiblas 后，我在 .Rprofile

中包含了以下几行

library(flexiblas)
flexiblas_load_backend('OPENBLASPTHREAD')
# [1] 2
flexiblas_switch(2)

或者当我想加载未安装在 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/ 下的英特尔 MKL BLAS/LAPACK 时，因此无法通过名称识别，例如 OPENBLASPTHREAD:

library(flexiblas)
flexiblas_load_backend("/opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_rt.so")
# [1] 2
flexiblas_switch(2)

Set libblas and liblapack used by R per user (not global/systemwide) Debian Linux 10