如何使用 numba 加速 python 函数

Question

我正在尝试使用 numba 加快 Floyd-Steinberg's dithering algorithm 的实施速度。在阅读初学者指南后，我将 @jit 装饰器添加到我的代码中：

def findClosestColour(pixel):
    colors = np.array([[255, 255, 255], [255, 0, 0], [0, 0, 255], [255, 255, 0], [0, 128, 0], [253, 134, 18]])
    distances = np.sum(np.abs(pixel[:, np.newaxis].T - colors), axis=1)
    shortest = np.argmin(distances)
    closest_color = colors[shortest]
    return closest_color

@jit(nopython=True) # Set "nopython" mode for best performance, equivalent to @njit
def floydDither(img_array):
    height, width, _ = img_array.shape
    for y in range(0, height-1):
        for x in range(1, width-1):
            old_pixel = img_array[y, x, :]
            new_pixel = findClosestColour(old_pixel)
            img_array[y, x, :] = new_pixel
            quant_error = new_pixel - old_pixel
            img_array[y, x+1, :] =  img_array[y, x+1, :] + quant_error * 7/16
            img_array[y+1, x-1, :] =  img_array[y+1, x-1, :] + quant_error * 3/16
            img_array[y+1, x, :] =  img_array[y+1, x, :] + quant_error * 5/16
            img_array[y+1, x+1, :] =  img_array[y+1, x+1, :] + quant_error * 1/16
    return img_array

但是，我收到以下错误：

Untyped global name 'findClosestColour': Cannot determine Numba type of <class 'function'>

我想我明白 numba 不知道 findClosestColour 的类型，但我刚开始使用 numba，不知道如何处理错误。

这是我用来测试函数的代码：

image = cv2.imread('logo.jpeg')
img = cv2.cvtColor(image, cv2.COLOR_BGR2RGB)
im_out = floydDither(img)

这是我使用的测试图像。

Answer 1

首先，无法从 Numba nopython jitted 函数（又名 njit 函数）调用纯Python 函数。这是因为 Numba 需要在编译时跟踪类型以生成高效的二进制文件。

此外，Numba 无法编译表达式 pixel[:, np.newaxis].T，因为 np.newaxis 似乎还不受支持（可能是因为 np.newaxis 是 None）。您可以改用pixel.reshape(3, -1).T。

请注意，您应该注意类型，因为当两个变量都是 np.uint8 类型时执行 a - b 会导致可能的溢出（例如。 0 - 1 == 255，甚至更令人惊讶：0 - 256 = 65280 当 b 是字面整数且 a 类型为 np.uint8）。请注意，数组是就地计算的，像素是在

之前写入的

尽管 Numba 做得很好，但生成的代码效率不会很高。您可以使用循环自己迭代颜色以找到最小索引。这要好一些，因为它不会生成 许多小的临时数组 。您还可以指定类型，以便 Numba 提前编译函数。话虽如此。这也使代码变得更底层等等 verbose/harder-to-maintain.

这是一个优化的实现：

@nb.njit('int32[::1](uint8[::1])')
def nb_findClosestColour(pixel):
    colors = np.array([[255, 255, 255], [255, 0, 0], [0, 0, 255], [255, 255, 0], [0, 128, 0], [253, 134, 18]], dtype=np.int32)
    r,g,b = pixel.astype(np.int32)
    r2,g2,b2 = colors[0]
    minDistance = np.abs(r-r2) + np.abs(g-g2) + np.abs(b-b2)
    shortest = 0
    for i in range(1, colors.shape[0]):
        r2,g2,b2 = colors[i]
        distance = np.abs(r-r2) + np.abs(g-g2) + np.abs(b-b2)
        if distance < minDistance:
            minDistance = distance
            shortest = i
    return colors[shortest]

@nb.njit('uint8[:,:,::1](uint8[:,:,::1])')
def nb_floydDither(img_array):
    assert(img_array.shape[2] == 3)
    height, width, _ = img_array.shape
    for y in range(0, height-1):
        for x in range(1, width-1):
            old_pixel = img_array[y, x, :]
            new_pixel = nb_findClosestColour(old_pixel)
            img_array[y, x, :] = new_pixel
            quant_error = new_pixel - old_pixel
            img_array[y, x+1, :] =  img_array[y, x+1, :] + quant_error * 7/16
            img_array[y+1, x-1, :] =  img_array[y+1, x-1, :] + quant_error * 3/16
            img_array[y+1, x, :] =  img_array[y+1, x, :] + quant_error * 5/16
            img_array[y+1, x+1, :] =  img_array[y+1, x+1, :] + quant_error * 1/16
    return img_array

原始版本快 14 倍，而最后一个版本快 19 倍。

如何使用 numba 加速 python 函数

How to speed up a python function with numba

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numpy

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