conda 更新后，python 内核在使用 matplotlib 时崩溃

Question

我用 conda:

创建了这个简单的环境

conda create -n test python=3.8.5 pandas scipy numpy matplotlib seaborn jupyterlab

jupyter lab 中的以下代码使内核崩溃：

import matplotlib.pyplot as plt

plt.subplot()

我在 Linux 上没有遇到这个问题。问题是当我尝试 Windows 10.

jupyter lab 控制台（我启动服务器的地方）没有错误，我不知道去哪里调查。

Answer 1

更新 2021-11-06

根据 main / packages / freetype.

conda

pkgs/main

freetype 2.10.4

如果问题仍然存在，请使用 conda list freetype 检查版本：freetype != 2.11.0
- 如果是 2.11.0，则根据解决方案更改版本，或 conda update --all（前提是 .condarc 配置文件中的默认频道未更改）。

解决方案

如果自 2021 年 10 月 27 日起安装 Anaconda, updating conda or freetype 后出现这种情况。
转到 Anaconda 提示并在任何受影响的环境中降级 freetype 2.11.0。
- conda install freetype=2.10.4
与使用 matplotlib 和任何 IDE 的任何软件包相关
- 例如，pandas.DataFrame.plot和seaborn
- Jupyter、Spyder、VSCode、PyCharm、命令行。

发现

使用 10 月 29 日星期五发布的 conda 的最新更新进行更新后出现问题。
使用 conda update --all 更新后，任何 IDE（不仅仅是 Jupyter）中与 matplotlib 相关的任何内容都存在问题。
- 我在 JupyterLab、PyCharm 和 python 中从命令提示符测试了这个。
- PyCharm: Process finished with exit code -1073741819
- JupyterLab：内核刚刚重启，没有相关错误或回溯
- 命令提示符：会短暂出现一个空白的交互式matplotlib window，然后出现一个新的命令行。
问题似乎出在 (base) 中的 conda update --all，然后是任何使用 matplotlib 的地块 API（例如 seaborn 和 pandas.DataFrame.plot) 在任何环境中杀死内核。
我不得不重新安装 Anaconda，但是 不更新 (base)，然后我的其他环境工作了。
我还没有弄清楚具体是什么导致了这个问题。
我用 python 3.8.12 和 python 3.9.7
当前测试：
- 以下是 conda 修订日志。
- 在 conda update --all 之前，此环境可以正常工作，但在更新后，使用 matplotlib 绘图会使 python 内核崩溃

  2021-10-31 10:47:22  (rev 3)
     bokeh  {2.3.3 (defaults/win-64) -> 2.4.1 (defaults/win-64)}
     click  {8.0.1 (defaults/noarch) -> 8.0.3 (defaults/noarch)}
     filelock  {3.0.12 (defaults/noarch) -> 3.3.1 (defaults/noarch)}
     freetype  {2.10.4 (defaults/win-64) -> 2.11.0 (defaults/win-64)}
     imagecodecs  {2021.6.8 (defaults/win-64) -> 2021.8.26 (defaults/win-64)}
     joblib  {1.0.1 (defaults/noarch) -> 1.1.0 (defaults/noarch)}
     lerc  {2.2.1 (defaults/win-64) -> 3.0 (defaults/win-64)}
     more-itertools  {8.8.0 (defaults/noarch) -> 8.10.0 (defaults/noarch)}
     pyopenssl  {20.0.1 (defaults/noarch) -> 21.0.0 (defaults/noarch)}
     scikit-learn  {0.24.2 (defaults/win-64) -> 1.0.1 (defaults/win-64)}
     statsmodels  {0.12.2 (defaults/win-64) -> 0.13.0 (defaults/win-64)}
     sympy  {1.8 (defaults/win-64) -> 1.9 (defaults/win-64)}
     tqdm  {4.62.2 (defaults/noarch) -> 4.62.3 (defaults/noarch)}
     xlwings  {0.24.7 (defaults/win-64) -> 0.24.9 (defaults/win-64)}

问题似乎是 freetype
- 从 2.11.0 降级到 2.10.4 解决了问题并使环境与 matplotlib
前往 post 错误报告并发现有 [Bug]: Matplotlib crashes Python #21511

Answer 2

我遇到了同样的问题，经过大量调查和故障排除后，修复非常简单：

conda update -c anaconda numpy

conda upgrade -c conda-forge matplotlib

在那之后运行很好，我的视觉效果绘制没有问题。

Answer 3

对于降级到 freetype=2.10.4 无效的任何人。在我的例子中，问题发生在从 conda-forge 频道安装新版本的 scikit-learn=1.11 之后。在尝试了许多选项后，以下对我有用：

将 numpy 从 main/pkg 重新安装到 conda-forge 频道
重新安装 mkl 软件包 conda -c intel mkl
从 conda-forge

matplotlib=4.3

这是一项非常严厉的措施，因为您必须重新安装所有依赖于 NumPy（Pandas、TensorFlow 等）的依赖项，但这是唯一对我有用的。

conda 更新后，python 内核在使用 matplotlib 时崩溃

After conda update, python kernel crashes when matplotlib is used

python

windows

matplotlib

conda

freetype

更新 2021-11-06

解决方案

发现