运行 R 从 Rscript 交互

Question

我正在尝试从 Rscript 启动闪亮的应用程序或交互式 .Rmd 文档。然而，我得到的只是一条消息

Listening on http://127.0.0.1:...

我相信这是因为 R 在交互模式下是运行（another post 关于这个）。我如何编写正确的 Rscript 才能使以下任一方法起作用？

我的脚本

#!/usr/bin/Rscript

## This
library(shiny)
runApp(appDir = "../app")

## Or this
## rmarkdown::run("Main.Rmd")

Answer 1

如果我正确理解你的问题，我能够用 littler, which I use in lieu of Rscript for scripting tasks that revolve around R. I'm running CentOS 7, and based on the code in your question it looks like you are on a Unix-like machine, so installing littler 实现这个应该不是问题。为了最小的可重复性，我使用了 RStudio 提供的默认闪亮应用程序和基于闪亮的 Rmarkdown 模板，分别将它们保存为 testapp（项目/应用程序目录名称）和 testRMD.rmd。然后，我有以下脚本：

testapp.r

#!/usr/bin/env r

shiny::runApp(
  "~/tmp/delete/testapp",
  port = 7088, 
  launch.browser = TRUE,
  host = "127.0.0.1")

testRMD.r

#!/usr/bin/env r

rmarkdown::run(
  file = "testRMD.rmd",
  dir = "~/tmp/delete",
  shiny_args = list(
    port = 7088,
    launch.browser = TRUE,
    host = "127.0.0.1"))

设置这些文件的权限以便可以执行它们 -

[nathan@nrussell R]$ chmod +x testapp.r testRMD.r

（chmod +u ... 应该足够了，但无论如何......），你应该从你的终端等全部设置为运行它们......

[nathan@nrussell R]$ ./testapp.r
Loading required package: shiny

Listening on http://127.0.0.1:7088

[nathan@nrussell R]$ ./testRMD.r
Loading required package: shiny

Listening on http://127.0.0.1:7088

我省略了 Rmd 文件的一些额外命令行输出，但我确信如果需要，可以很容易地抑制它。无论如何，这似乎工作正常 - 闪亮的应用程序和 Rmarkdown 应用程序都是交互式的，就像从 RStudio 启动时一样 - 但如果你有其他想法，请澄清。

Answer 2

谢谢@nrussell，你的例子对我帮助很大！

这是我在 Windows 10 上启动交互式降价文档的解决方案。

REM Change to correct directory
cd "C:\Users\me\Documents\project_folder\"

REM Print files available (not required, but helpful)
dir

REM Point system to R's Pandoc with Rscript then launch
"C:\Program Files\R\R-4.0.3\bin\Rscript.exe" -e ^
"Sys.setenv(RSTUDIO_PANDOC='C:/Users/me/Documents/RStudio/bin/pandoc'); rmarkdown::run(file = 'myInteractiveMarkdown.Rmd', shiny_args = list(launch.browser = TRUE, host = '127.0.0.1'))"

我发现最初有两个错误：

当我没有将系统环境指向 R 的 pandoc 时，它给出了错误消息 error pandoc version 1.12.3 or higher is required，我使用说明
当我在shiny_args中设置端口时，后续执行bat文件会报错端口已经忙

运行 R 从 Rscript 交互

Run R interactively from Rscript

r

rscript

r-markdown

shiny

我的脚本