使用 rpy2 检查我是否安装了最新版本的 R 包

Question

我有以下方法检查是否安装了 R 包。这有助于我避免每次运行代码时都安装软件包。

我想添加功能，以便我们可以检查是否安装了 R 包 AND 如果它是最新版本。我已经查看了 rpy2 文档，但我看不到执行此操作的方法。

我想知道是否有人对我如何实现这一目标有任何想法？干杯

    def get_source_package(self, package_name):
        
        # Check if R package is installed. If it is installed, import it
        if packages.isinstalled(package_name):
            self.source_package = packages.importr(package_name)
            return self.source_package

        # Check if R package is installed. If not, install and then import it
        else:
            utils = packages.importr('utils')
            utils.chooseCRANmirror(ind=1)
            utils.install_packages(package_name)
            self.source_package = packages.importr(package_name)
            return self.source_package

Answer 1

您可以使用 utils 中提供的其他两个函数来获取已安装和可用软件包的版本，并将两者进行比较以获得答案。中提供了相关的R代码，可以翻译成Python如下：

from rpy2.robjects.packages import importr

utils = importr('utils')

def extract_versions(package_data):
    return dict(zip(
        package_data.rx(True, 'Package'),  # get Package column
        package_data.rx(True, 'Version')   # get Version column
    ))


i = extract_versions(utils.installed_packages())
a = extract_versions(utils.available_packages())

package_name = 'ggplot2'

is_latest_version = i[package_name] == a[package_name]

使用 rpy2 检查我是否安装了最新版本的 R 包

Using rpy2 to check if I have the latest version of an R package installed

python

r

rpy2