在 bash 中创建一个循环脚本，其中 2 个变量递增，第二个变量根据第一个变量递增

Question

我需要创建一个循环来增加 2 个变量（数值），一个根据另一个增加，并且都与我必须发送到集群的作业相关。

基本上我必须创建各种组，这些组由这两个变量定义；例如第一组从 1 到 10（1 是第一个变量，10 是第二个变量），第二组是 11-20 等等......

我正在创建 169 个组，因为我有 1690 个人，并且我运行 Chromopainter 脚本 169 次（每个组一个）。

我想告诉我的剧本：

给定初始变量 1 和 10，执行脚本，为每个变量递增 10，然后再次执行脚本（循环）。我知道要增加变量我可以这样做：

for i in {0..159..10}
for j in {10..169..10}

但我无法将它应用到整个事情上。这是我到目前为止写的：

for count in {1..169}
do
    sbatch -J estimate.chr1 -o estimate.chr1.out -e estimate.chr1.error --wrap="module load ChromoPainter/2;
ChromoPainterv2 -g filename.chr1.phase -r fil.recombfile -t IDFILE_FORMAT.txt -o filename.chr1._ChPestimate.$count -a $i $j -i 15 -in -iM"
done

如果我想单独发送脚本，对于第一组，它会像这样工作：

ChromoPainterv2 -g filename.chr1.phase -r fil.recombfile -t IDFILE_FORMAT.txt -o filename.chr1._ChPestimate.$count -a 1 10 -i 15 -in -iM

有什么想法吗？提前谢谢你

Answer 1

loop to make 2 variables (numerical) increase, one according to the other

1 to 10 (1 would be the 1st variable, 10 the 2nd),

所以只要除以10，就是线性关系

for count in {1..169}; do
   i=$count
   j=$(( 1 + (i - 1) / 10 ))
   printf "%d %d\n" "$i" "$j"
done

Answer 2

我认为你在这个问题上过度设计了。使用您的 $count 作为您需要的其他号码的主要来源。并以零为基础简化了微积分：

for count in {0..168}
do
    i=$((count*10+1))
    j=$(((count+1)*10))
    
    sbatch -J estimate.chr1 -o estimate.chr1.out -e estimate.chr1.error --wrap="module load ChromoPainter/2; ChromoPainterv2 -g filename.chr1.phase -r fil.recombfile -t IDFILE_FORMAT.txt -o filename.chr1._ChPestimate.$((count+1)) -a $i $j -i 15 -in -iM"
done

在 bash 中创建一个循环脚本，其中 2 个变量递增，第二个变量根据第一个变量递增

Create a loop script in bash in which 2 variables are incremented, the second one according to the first variable

variables

bash

counter

loops

script