网络构建期间的关键错误（缺少列）

Question

我正在尝试按照这种方法来识别横向节点。不幸的是我收到了这个错误：

KeyError: 'Source_Attrib'

代码：

import networkx as nx
from matplotlib import pyplot as plt

G = nx.from_pandas_edgelist(df, 'Node', 'Target')
df_pos = nx.spring_layout(G,k = 0.3) 

nx.draw_networkx(G, df_pos)
plt.show()

# Iterate through all edges
nx.set_node_attributes(G, labels, "Source_Attrib")
for v, w in G.edges:
    print(v)
    # Compare `Label` property of edge endpoints
    # Set edge `internal` property to True if they match
    if G.nodes[v]["Source_Attrib"] == G.nodes[w]["Target_Attrib"]: # Two nodes are directly connected
        G.edges[v, w]["internal"] = True
    else:
        G.edges[v, w]["internal"] = False

数据集：

Source  Target  Weight  Target_Attrib   Source_Attrib
143 n1  emerysmith.net  6.9 -0.5    -0.5
155 n2  n3  25.6    -1.0    -1.0
156 n2  n3  15.6    -1.0    -1.0
157 n2  n6  14.5    -1.0    -1.0
158 n3  n2  11.6    -0.5    -1.0
180 n3  n4  25.6    -1.0    -1.0
183 n6  n6  8.6 -0.5    -1.0
184 n6  n3  8.4 -1.0    -1.0
230 n7  n6  11.4    -1.0    -0.5
231 n8  n6  10.9    -1.0    -0.5

我想像这样 post 中的输出可视化：https://www.fatalerrors.org/a/python-networkx-learning-notes.html，其中两个类之间的节点被 linked 到不同的类（在 link 的例子中，这些节点有虚线）。

---------------------------------------------------------------------------
KeyError                                  Traceback (most recent call last)
<ipython-input-155-25042fae7842> in <module>
      6     # Set edge `internal` property to True if they match
----> 7     if G.nodes[v]["Source_Attrib"] == G.nodes[w]["Label_Sim_urls"]: # Two nodes are directly connected
      8         G.edges[v, w]["internal"] = True
      9     else:

KeyError: 'Source_Attrib'

Answer 1

您目前没有阅读列 source/target 属性。例如，您可以简单地将它们读取为边缘属性，然后在边缘上循环一次：

G = nx.from_pandas_edgelist(df, 'Node', 'Target', edge_attr=True, create_using=nx.DiGraph)
for edge in G.edges:
    u, v = edge
    G.nodes[u]["Source_Attrib"] = G[u][v]["Source_Attrib"]
    G.nodes[v]["Source_Attrib"] = G[u][v]["Target_Attrib"]

假设数据是正确的，因为您可以多次覆盖属性。如果需要，您可能希望将其转换回无向图。

网络构建期间的关键错误（缺少列）

Key error (missing column) during network build

python

networkx

pandas