更改 .nextflow 文件夹的位置?
change the location of the .nextflow folder?
当我 运行 nextflow 时,我得到一个 .nextflow
文件夹,但我找不到更改其位置的方法(即它不是 -work-dir
)。如何更改 .nextflow
文件夹的位置?
我看过 launchDir
但它似乎是一个只读的隐式变量,不能在 CLI 中被覆盖,而且 --launchDir
选项仅对 k8s 范围有效(在 gitter)
中查看原始聊天记录
我正在使用 Nextflow 20.10.0 build 5430。
保持整洁是令人钦佩的。从 this comment 开始,看起来唯一的方法(不做疯狂的事情...)是更改到您希望 .nextflow
缓存目录存在的目录并指向所有其他选项(即 -work-dir
, -log
等) 到一个单独的目录:
If you want .nextflow
in dir A and the pipeline work dir in B:
cd A
nextflow run -w B
The .nextflow
has to be in the launching
directory to properly maintain the history of the executions.
当我 运行 nextflow 时,我得到一个 .nextflow
文件夹,但我找不到更改其位置的方法(即它不是 -work-dir
)。如何更改 .nextflow
文件夹的位置?
我看过 launchDir
但它似乎是一个只读的隐式变量,不能在 CLI 中被覆盖,而且 --launchDir
选项仅对 k8s 范围有效(在 gitter)
我正在使用 Nextflow 20.10.0 build 5430。
保持整洁是令人钦佩的。从 this comment 开始,看起来唯一的方法(不做疯狂的事情...)是更改到您希望 .nextflow
缓存目录存在的目录并指向所有其他选项(即 -work-dir
, -log
等) 到一个单独的目录:
If you want
.nextflow
in dir A and the pipeline work dir in B:cd A nextflow run -w B
The
.nextflow
has to be in the launching directory to properly maintain the history of the executions.