Slurm 脚本和分配核心数

Question

所以我开始研究一些基本的 HPC 主题。但是，我有一个非常基本的问题： 如何在 slurm 脚本中分配正确（或所需）数量的内核？

我知道这是一个相当基本的问题，但我无法在网上或教科书中找到任何可以帮助我解决问题的内容。部分 slurm 脚本的图像：

非常感谢任何帮助。

Answer 1

在您显示的片段中，它有选项

#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1

这意味着（就 Slurm 而言）您将启动 1 个进程 (--ntasks=1)，该进程可以访问 1 个核心资源 (-cpus-per-task=1)。该进程如何绑定到核心是一个稍微不同的问题，但在大多数 HPC 系统上，这通常意味着调度程序将为您的进程分配 1 个物理核心。

但是，您的片段中还有：

#SBATCH --exclusive
#SBATCH --nodes=1

这些选项通常意味着您要求独占访问单个节点（即只允许您的作业运行访问该节点）。例如，如果您正在使用的 HPC 系统上的节点具有 64 个物理内核；然后，就目前而言，这个示例片段会要求您使用一个完整的节点（64 个核心），然后指定您只想使用其中的一个（来自 --ntasks=1 和 -cpus-per-task=1）。

如果您想将此更改为要求 32 个进程运行在 1 个节点上的 32 个内核上以独占访问方式运行，您可以使用类似的东西：

#SBATCH --ntasks=32
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --exclusive
#SBATCH --nodes=1

Slurm 脚本和分配核心数

Slurm Scripts and Assigning Number of Cores

slurm

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