Error: C stack usage when compile R Markdown

Question

我收到一个新错误，当我尝试编译 R Markdown 文件时出现下一条消息：

Error: C stack usage  7971408 is too close to the limit
Execution halted

我做了一些研究，发现有些人有同样的错误：

Error: C stack usage is too close to the limit
R mapping (C stack usage 7971616 is too close to the limit)
C stack usage 7972356 is too close to the limit #335

但是这些人在某些功能或类似方面存在问题。我为了尝试解决这种情况而采取的行动：

卸载 R 和 RStudio，重新安装两者的最新版本，重新启动我的计算机...没有。
尝试更改ulimit -s，这一点很有趣，因为这是我在R终端上的ulimit -a：

geomicrobio-mac:~ geomicrobio$ ulimit -a
core file size          (blocks, -c) 0
data seg size           (kbytes, -d) unlimited
file size               (blocks, -f) unlimited
max locked memory       (kbytes, -l) unlimited
max memory size         (kbytes, -m) unlimited
open files                      (-n) 10240
pipe size            (512 bytes, -p) 1
stack size              (kbytes, -s) 8192
cpu time               (seconds, -t) unlimited
max user processes              (-u) 1392
virtual memory          (kbytes, -v) unlimited

当我尝试在 R 终端上将 ulimit -s 更改为 unlimited 或 65532 时，它没有改变。

我的终端 (macOS Monterey v12.0.1) 的 ulimit -a 是：

-t: cpu time (seconds)              unlimited
-f: file size (blocks)              unlimited
-d: data seg size (kbytes)          unlimited
-s: stack size (kbytes)             65532
-c: core file size (blocks)         0
-v: address space (kbytes)          unlimited
-l: locked-in-memory size (kbytes)  unlimited
-u: processes                       1392
-n: file descriptors                2560

R Markdown 就是这样，我可以做 Shinny 应用程序和运行脚本等，但我无法编译任何 R Markdown，尽管它只包含文本。

这是我在控制台上输入 base::Cstack_info() 时的信息：

      size    current  direction eval_depth 
   7969177      14032          1          2

我的 R 版本：

platform       x86_64-apple-darwin17.0     
arch           x86_64                      
os             darwin17.0                  
system         x86_64, darwin17.0          
status                                     
major          4                           
minor          1.2                         
year           2021                        
month          11                          
day            01                          
svn rev        81115                       
language       R                           
version.string R version 4.1.2 (2021-11-01)
nickname       Bird Hippie

如果你知道如何解决这个问题，我非常感谢你的帮助。

谢谢。

Answer 1

我刚刚删除了.Rprofile .-.

Error: C stack usage when compile R Markdown

Error: C stack usage when compile R Markdown

r

r-markdown