在查找和使用管道中调用外部命令

Question

我想知道是否有一种方法可以在 AIX 6.x 上使用 find 命令从某个目录（包括子目录）搜索所有文件，然后再调用外部命令（例如 hlcat）[=25] =] 将它们转换为可读格式，然后可以通过 grep 命令进行管道传输以查找模式，而不是在 shell?

中使用循环

e.g. find . -type f -name “*.hl7” -exec hlcat {} | grep -l “pattern” \;

上面的命令不起作用，我必须使用 while 循环来显示内容并搜索模式，如下所示：

find . -type f -name “*.hl7” -print | while read file; do
hlcat $file | grep -l “pattern”;
done

同时，这些 HL7 文件已用圆括号重命名，这样可以防止在文件名周围没有双引号的情况下打开它们。

e.g. hlcat (patient) filename.hl7 will fail to open.
        hlcat “(patient) filename.hl7” will work.

简而言之，我正在查找命令中寻找一种干净简洁的单行方法，并查看和搜索这些带有圆括号名称的 HL7 文件的内容。

非常感谢，乔治

P.S。 HL7原始数据由一条连续的线组成，不可读，除非使用hlcat等工具将其转换成可读的格式。在

Answer 1

更新：简单的方法

find . -type f -name '*.hl7' -exec grep -iEl 'Barry|Jolene' {} +

注意： 不过您可能会得到一些误报。请参阅下文进行有针对性的搜索。

正在一堆 HL7v2 文件中搜索名字：

1。查看 HL7v2 文件格式

HL7 示例v2 PID 段：

PID|||56782445^^^UAReg^PI||KLEINSAMPLE^BARRY^Q^JR||19620910|M|||

PID段分解：

Seq	NAME	HHIC USE	LEN
0	PID keyword	Segment Type	3
3	Patient ID	Medical Record Num	250
5	Patient Name	Last^First^Middle	250
7	Date/Time Of Birth	YYYYMMDD	26
8	Sex	F, M, or U	1

2。编写有针对性的搜索

使用 grep (AIX)：

find . -type f -name '*.hl7' -exec grep -iEl '^PID\|([^|]*\|){4}[^^|]*\^(Barry|Jolene)\^' {} +

与awk:

find . -type f -name '*.hl7' -exec awk -v firstname='^(Barry|Jolene)$' '
    BEGIN { FS="|" }
    FNR == 1 { if( found ) print filename; found = 0; filename = FILENAME }
     == "PID" { split(, name, "^"); if (toupper(name[2]) ~ toupper(firstname)) { found = 1 } }
    END { if ( found ) print filename }
' {} +

备注： 这个 awk 解决方案的优点是您将 名字正则表达式 作为参数。这个解决方案很容易扩展，例如搜索 last name.

在查找和使用管道中调用外部命令

Calling external command in find and using pipe

unix

bash

aix

更新：简单的方法

正在一堆 HL7v2 文件中搜索名字：

1。查看 HL7v2 文件格式

2。编写有针对性的搜索

在查找和使用管道中调用外部命令

Calling external command in find and using pipe

unix

bash

aix

更新：简单的方法

正在一堆 HL7v2 文件中搜索 名字：

1。查看 HL7v2 文件格式

2。编写有针对性的搜索

正在一堆 HL7v2 文件中搜索名字：