具有 2 个不同来源但 converging/shared 变量 [R] 的冲积地块

Question

我有使用 ggalluvial 包制作冲积地块的经验。但是，我运行遇到了一个问题，我正在尝试创建一个冲积地块，其中包含两个不同的源并收敛到 1 个变量。

这里是示例数据

library(dplyr)
library(ggplot2)
library(ggalluvial)

data <- data.frame(
  unique_alluvium_entires = seq(1:10),
  label_1 = c("A", "B", "C", "D", "E", rep(NA, 5)),
  label_2 = c(rep(NA, 5), "F", "G", "H", "I", "J"),
  shared_label = c("a", "b", "c", "c", "c", "c", "c", "a", "a", "b")
)

这是我用来制作情节的代码

#prep the data
data <- data %>%
  group_by(shared_label) %>%
  mutate(freq = n())

data <- reshape2::melt(data, id.vars = c("unique_alluvium_entires", "freq"))
data$variable <- factor(data$variable, levels = c("label_1", "shared_label", "label_2"))

#ggplot
ggplot(data,
       aes(x = variable, stratum = value, alluvium = unique_alluvium_entires,
           y = freq, fill = value, label = value)) +
  scale_x_discrete(expand = c(.1, .1)) + 
  geom_flow() +
  geom_stratum(color = "grey", width = 1/4, na.rm = TRUE) +
  geom_text(stat = "stratum", size = 4) +
  theme_void() +
  theme(
   axis.text.x = element_text(size = 12, face = "bold")
  )

（显然我还不能嵌入图片）

如您所见，我可以删除 NA 值，但 shared_label 没有正确“堆叠”。在 shared_label 列中，每个唯一的行都应相互堆叠。这也将解决尺寸问题，使它们沿 y 轴的尺寸相等。

有什么办法解决这个问题吗？我试过 ggsankey 但同样的问题出现了，我无法删除 NA 值。非常感谢任何提示！

Answer 1

此图是“流”统计变换的预期结果，这是“流”图形对象的默认值。（也就是说，geom_flow() = geom_flow(stat = "flow")。）看起来您想要的是改为指定“冲积层”统计变换。下面我使用了您的所有代码，但仅复制和编辑了 ggplot() 调用。

#ggplot
ggplot(data,
       aes(x = variable, stratum = value, alluvium = unique_alluvium_entires,
           y = freq, fill = value, label = value)) +
  scale_x_discrete(expand = c(.1, .1)) +
  geom_flow(stat = "alluvium") +  # <-- specify alternate stat
  geom_stratum(color = "grey", width = 1/4, na.rm = TRUE) +
  geom_text(stat = "stratum", size = 4) +
  theme_void() +
  theme(
    axis.text.x = element_text(size = 12, face = "bold")
  )
#> Warning: Removed 2 rows containing missing values (geom_text).

^{由 reprex package (v2.0.1)}

于 2021-12-10 创建

具有 2 个不同来源但 converging/shared 变量 [R] 的冲积地块

Alluvial plot with 2 different sources but a converging/shared variable [R]

r

ggplot2

dplyr

sankey-diagram

ggalluvial