如何使用 R reticulate 安装 gekko 包？

Question

我无法通过 R reticulate 安装 gekko 包。我的 R 版本是 3.4.4，我的 Python 版本是 3.8.8，我在 Python 中使用 Gekko 没有问题。所以我尝试以我知道的这两种方式在 R 上安装：

py_install("gekko")
网状::conda_install("my_conda_environment", "gekko")

然而，在这两种情况下，我都收到以下相同的错误。

PackagesNotFoundError：当前渠道不提供以下软件包：

壁虎

当前频道：

我没有在 Anaconda 文档中找到其他选择。我该如何解决这个问题？

编辑：我根据John Hedengren的回答和reticulate docs中的参考资料解决了我的问题。为此，我需要创建一个新环境以在 R 中使用以下代码指定 Python 版本和包：

reticulate::py_install(
    packages = c(
        "numpy",  
        "pandas", # Or another packages that you need
        "gekko"
    ),
    envname  = "r-gekko",
    method = "conda", # On Windows, the 'conda' method is always used
    python_version = "3.8.8",
    pip = TRUE # It's mandatory to install gekko
)

Answer 1

Gekko 可从 pypi.org 和 pip install gekko 获得，但不适用于 conda install gekko 的 conda 包管理器。这里有更多关于 how to install Python packages 和 pip 的信息。您可能已经知道这一点，因为您在 Python 中使用 gekko，但我将其包含在此处以备不时之需。

两个潜在的问题是：

安装了多个 Python 版本，gekko 未安装与 R 一起使用的版本。
Reticulate 没有使用 PyPi 存储库来安装 gekko。 additional information 管理源（Conda 或 PyPi）以检索包。

我对 R 不熟悉，但其他人也有类似的问题，例如：

Error when installing package from PyPi in R using reticulate and Anaconda3
reticulate conda_install fails to install package from PyPI

Answer 2

在类似情况下寻求帮助的更一般的答案：

在 R 的新环境中安装 gekko 和其他包。

reticulate::py_install(
    packages = c(
        "gekko",
        "other_package==x.x.x", # It's possible to specify the package version 
        ... 
    ),
    envname = "new_env",
    method = "conda", # For Windows
    python_version = "3.x.x",
    pip = TRUE
)

使用新环境调用 reticulate 包。

Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON = "/Users/user_name/anaconda#/envs/new_env/python.exe")
library(reticulate)

运行你的 Python R 中带有 gekko 的脚本

source_python("path/script.py")

如何使用 R reticulate 安装 gekko 包？

How can I install gekko package using R reticulate?

python

r

anaconda

gekko

reticulate