dbplyr select 不重复列

dbplyr select not duplicate columns

我正在使用 R 编程语言。我在服务器上有以下 table:

age=18:29
height=c(76.1,77,78.1,78.2,78.8,79.7,79.9,81.1,81.2,81.8,82.8,83.5)
gender=c("M","F","M","M","F","F","M","M","F","M","F","M")
testframe = data.frame(age=age,height=height,height2=height,gender=gender,gender2=gender)

head(testframe)

  age height height2 gender gender2
1  18   76.1    76.1      M       M
2  19   77.0    77.0      F       F
3  20   78.1    78.1      M       M
4  21   78.2    78.2      M       M
5  22   78.8    78.8      F       F
6  23   79.7    79.7      F       F

我的目标是从上面的 table 中删除相同的列,即使它们具有不同的名称。因此,最终产品将如下所示:

  age height gender
1  18   76.1      M
2  19   77.0      F
3  20   78.1      M
4  21   78.2      M
5  22   78.8      F
6  23   79.7      F

我的问题: 我想直接从服务器上的 table 中删除这些重复的列。我一直在阅读 R 中的“dbplyr”库,我不确定这是否能够做到这一点。我尝试了以下两种方法:

方法一:

library(RODBC)
library(sqldf)
library(dplyr)
library(dbplyr)
library(odbc)

con = odbcConnect("some name", uid = "some id", pwd = "abc")

con <- DBI::dbConnect(RSQLite::SQLite(), ":memory:")
copy_to(con, testframe)



final_1 = testframe %>%
  dplyr::select(., which(as.list(.) %>%
                           duplicated %>%
                           `!`))

方法二:

mtcars2 <- tbl(con, "testframe")


final_2 = mtcars2 %>%
    dplyr::select(., which(as.list(.) %>%
                               duplicated %>%
                               `!`))

在上面的示例中,数据(“testframe”)在我的本地环境中,但我尝试使用 copy_con 语句来尝试查看如果数据在打开时这些语句是否有效服务器。

我的问题:上面示例中的代码似乎有效 - 但我不确定上面的代码是否只能对本地环境中的数据执行这些语句 -或者它也可以对位于服务器上的数据执行这些相同的语句。有人可以对此发表评论吗?

谢谢!

dbplyr 的工作原理是将 dplyr 命令翻译成相应的数据库语言,然后再将这些命令传递给数据库。我强烈怀疑它会很难翻译 which(as.list(.) %>% duplicated %>% '!'),因为你要求它翻译这些指令的含义,而不是字面命令对命令的翻译。

您可以使用模拟数据库连接测试 dbplyr 翻译。例如:

library(dplyr)
library(dbplyr)

age=18:29
height=c(76.1,77,78.1,78.2,78.8,79.7,79.9,81.1,81.2,81.8,82.8,83.5)
gender=c("M","F","M","M","F","F","M","M","F","M","F","M")
testframe = data.frame(age=age,height=height,height2=height,gender=gender,gender2=gender)

remote_table = tbl_lazy(testframe , con = simulate_mssql()) # the simulation

remote_table %>%
  mutate(height3 = height2) %>%
  select(height, height2, height3) %>%
  show_query()

如果这产生了有效的数据库代码,那么您就知道您的 dplyr 命令正在按预期工作。但是,如果这产生了意外的数据库命令(或 R 命令出现在翻译中),那么 dbplyr 无法将您的指令翻译成数据库语言。

对于这类问题,我可能会采用如下方法:

all_column_names = colnames(remotetable)
num_cols = length(all_column_names)
is_dupe = rep(0, num_cols)

for(ii in 1:(num_cols - 1)){
  for(jj in 2:num_cols) {
    colA = all_column_names[ii]
    colB = all_column_names[jj]

    this_check = remotetable %>%
      mutate(compare = ifelse(!!sym(colA) == !!sym(colB), 1, 0)) %>%
      ungroup() %>%
      summarise(num = n(), matches = sum(compare)) %>%
      collect()

    if(this_check$num == this_check$matches)
      is_dupe[jj] = 1
  }
}

想法是遍历所有的列对,并使用基本的 dplyr 命令检查每个值是否相等。如果相等值的数量等于值的总数,则将该列作为重复项进行匹配。然后,您可以将输出用于 select 非重复列。

备注

  • !!sym(colA) 获取存储在变量 colA 中的文本并将其转换为 dbplyr 可以处理的列名。
  • collect()是从数据库拉取数据到本地R内存的命令。仅当您确信数据适合本地内存时才执行此操作。