如何用 python 按行读取大图像
how to read a large image by lines with python
我正在尝试处理一些大小超过 1G 的卫星照片。我在 python 中编码，并且我已经尝试过这些方法。
image = np.array(io.imread(each_dir))
image = np.array(TiffImagePlugin.open(each_dir))
image = np.array(Image.open(each_dir))
只有io.read适用于大小为200Mb的照片，当大小大于1G时，会出现错误
MemoryError: Unable to allocate 17.1 GiB for an array with shape (156105, 39136, 3) and data type uint8
我已将 RAM 从 16g 更改为 32g，但这不起作用。所以我想问一下有没有一种方法可以逐行读取图像而不是一次读取整个图像？
非常感谢。
我建议您在开始之前将相当大的 TIFF 平铺在 Python 之外。大量借鉴 John (@jcupitt) 的回答 here，您可以使用 vips.
我在终端中创建了一个 39100x156100 的 TIFF，并使用 vips 的 “DeepZoom Save” 功能对其进行了平铺：
vips dzsave big.tif outdir --depth one --tile-size 8192 --overlap 0 --suffix .tif
用了 38 秒，2GB 内存，还是很省的。下面是它生成的图块及其元数据的列表。
结果
0_0.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_10.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_11.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_12.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_13.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_14.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_15.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_16.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_17.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_18.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_19.tif TIFF 8192x452 8192x452+0+0 8-bit sRGB 10.594MiB 0.000u 0:00.000
0_1.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_2.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_3.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_4.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_5.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_6.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_7.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_8.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_9.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_0.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_10.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_11.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_12.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_13.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_14.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_15.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_16.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_17.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_18.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_19.tif TIFF 8192x452 8192x452+0+0 8-bit sRGB 10.594MiB 0.000u 0:00.000
1_1.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_2.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_3.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_4.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_5.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_6.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_7.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_8.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_9.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_0.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_10.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_11.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_12.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_13.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_14.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_15.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_16.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_17.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_18.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_19.tif TIFF 8192x452 8192x452+0+0 8-bit sRGB 10.594MiB 0.000u 0:00.000
2_1.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_2.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_3.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_4.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_5.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_6.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_7.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_8.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_9.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_0.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_10.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_11.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_12.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.010u 0:00.000
3_13.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_14.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_15.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_16.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_17.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_18.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_19.tif TIFF 8192x452 8192x452+0+0 8-bit sRGB 10.594MiB 0.000u 0:00.000
3_1.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_2.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_3.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_4.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_5.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_6.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_7.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_8.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_9.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
4_0.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_10.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_11.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_12.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_13.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_14.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_15.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_16.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_17.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_18.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_19.tif TIFF 6332x452 6332x452+0+0 8-bit sRGB 8.18867MiB 0.000u 0:00.000
4_1.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_2.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_3.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_4.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_5.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_6.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_7.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_8.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_9.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
另一种完全不同的方法可能是使用 stream 命令，它是 ImageMagick 套件的一部分 - 也在 Python 之外。因此，我制作了一个名为 big.tif 的 50,000x50,000 像素 RGB TIFF，然后将底部的 1/5（即第 40,000 行开始）流式传输到 RGB888 原始文件中，如下所示：
magick stream -map rgb -storage-type char -extract 50000x10000+0+40000 big.tif bottom.dat
该命令在我的 Mac 上运行大约 18 秒。然后，您可以像这样将其读入 Python 中的 Numpy 数组：
import numpy as np
# Load RGB888 file and reshape back to its correct shape
im = np.fromfile('bottom.dat', dtype=np.uint8).reshape((10000,50000,3))
如果您不熟悉 ImageMagick 的几何规格，上述命令中的 50000x10000+0+40000 部分表示 “提取 50,000 像素宽10,000 像素高的区域，其左上角距左边缘 0 像素，距顶部向下 40,000 像素。
您可以使用 pyvips 来读出平铺 TIFF 的部分内容。例如：
import pyvips
image = pyvips.Image.new_from_file("huge-tiled-image.tiff")
tile = image.crop(100, 110, 1000, 1000)
tile = image.crop(8000, 6500, 1000, 1000)
...
其中四个数字是左、上、宽和高，以像素为单位。它非常快，你可以读出任何你喜欢的区域，它只会解码你要求的图像部分，并保留最近解压像素的缓存。
你可以在pyvips中做进一步的处理，或者将像素渲染成一个数组然后交给numpy，见：
我正在尝试处理一些大小超过 1G 的卫星照片。我在 python 中编码，并且我已经尝试过这些方法。
image = np.array(io.imread(each_dir))
image = np.array(TiffImagePlugin.open(each_dir))
image = np.array(Image.open(each_dir))
只有io.read适用于大小为200Mb的照片，当大小大于1G时，会出现错误
MemoryError: Unable to allocate 17.1 GiB for an array with shape (156105, 39136, 3) and data type uint8
我已将 RAM 从 16g 更改为 32g，但这不起作用。所以我想问一下有没有一种方法可以逐行读取图像而不是一次读取整个图像？ 非常感谢。
我建议您在开始之前将相当大的 TIFF 平铺在 Python 之外。大量借鉴 John (@jcupitt) 的回答 here，您可以使用 vips.
我在终端中创建了一个 39100x156100 的 TIFF，并使用 vips 的 “DeepZoom Save” 功能对其进行了平铺：
vips dzsave big.tif outdir --depth one --tile-size 8192 --overlap 0 --suffix .tif
用了 38 秒，2GB 内存，还是很省的。下面是它生成的图块及其元数据的列表。
结果
0_0.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_10.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_11.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_12.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_13.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_14.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_15.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_16.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_17.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_18.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_19.tif TIFF 8192x452 8192x452+0+0 8-bit sRGB 10.594MiB 0.000u 0:00.000
0_1.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_2.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_3.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_4.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_5.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_6.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_7.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_8.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
0_9.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_0.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_10.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_11.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_12.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_13.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_14.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_15.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_16.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_17.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_18.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_19.tif TIFF 8192x452 8192x452+0+0 8-bit sRGB 10.594MiB 0.000u 0:00.000
1_1.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_2.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_3.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_4.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_5.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_6.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_7.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_8.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
1_9.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_0.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_10.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_11.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_12.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_13.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_14.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_15.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_16.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_17.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_18.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_19.tif TIFF 8192x452 8192x452+0+0 8-bit sRGB 10.594MiB 0.000u 0:00.000
2_1.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_2.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_3.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_4.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_5.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_6.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_7.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_8.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
2_9.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_0.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_10.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_11.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_12.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.010u 0:00.000
3_13.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_14.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_15.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_16.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_17.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_18.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_19.tif TIFF 8192x452 8192x452+0+0 8-bit sRGB 10.594MiB 0.000u 0:00.000
3_1.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_2.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_3.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_4.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_5.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_6.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_7.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_8.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
3_9.tif TIFF 8192x8192 8192x8192+0+0 8-bit sRGB 192.001MiB 0.000u 0:00.000
4_0.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_10.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_11.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_12.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_13.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_14.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_15.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_16.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_17.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_18.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_19.tif TIFF 6332x452 6332x452+0+0 8-bit sRGB 8.18867MiB 0.000u 0:00.000
4_1.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_2.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_3.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_4.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_5.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_6.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_7.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_8.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
4_9.tif TIFF 6332x8192 6332x8192+0+0 8-bit sRGB 148.407MiB 0.000u 0:00.000
另一种完全不同的方法可能是使用 stream 命令，它是 ImageMagick 套件的一部分 - 也在 Python 之外。因此，我制作了一个名为 big.tif 的 50,000x50,000 像素 RGB TIFF，然后将底部的 1/5（即第 40,000 行开始）流式传输到 RGB888 原始文件中，如下所示：
magick stream -map rgb -storage-type char -extract 50000x10000+0+40000 big.tif bottom.dat
该命令在我的 Mac 上运行大约 18 秒。然后，您可以像这样将其读入 Python 中的 Numpy 数组：
import numpy as np
# Load RGB888 file and reshape back to its correct shape
im = np.fromfile('bottom.dat', dtype=np.uint8).reshape((10000,50000,3))
如果您不熟悉 ImageMagick 的几何规格，上述命令中的 50000x10000+0+40000 部分表示 “提取 50,000 像素宽10,000 像素高的区域，其左上角距左边缘 0 像素，距顶部向下 40,000 像素。
您可以使用 pyvips 来读出平铺 TIFF 的部分内容。例如：
import pyvips
image = pyvips.Image.new_from_file("huge-tiled-image.tiff")
tile = image.crop(100, 110, 1000, 1000)
tile = image.crop(8000, 6500, 1000, 1000)
...
其中四个数字是左、上、宽和高，以像素为单位。它非常快，你可以读出任何你喜欢的区域，它只会解码你要求的图像部分，并保留最近解压像素的缓存。
你可以在pyvips中做进一步的处理，或者将像素渲染成一个数组然后交给numpy，见：