RMarkdown 错误图呈现但不会编织 - 菜鸟

RMarkdown Error plot rendered but would not knit - noob

问题:rmarkdown中出现plot但是不编织。出现两个错误。该文件没有其他问题。

  1. 错误window打开文件时出错“系统找不到指定的文件”
  2. 我在尝试编织成 pdf 后在渲染中收到如下所示的消息

第 239 行解析错误(text = x,scrfile = src):,text>:4:16:意外','

3: alpha = 0.9, width = 7) + theme_minimal(base_size = 8) + #Note 最小主题 alpha

4:阿尔法 = 0.9

调用:... -> parse_all -> parse_all.character -> 解析

我进行了很多更改以使其正常工作,包括 alpha 版并确认代码已正确链接到其依赖项。我已确保 dplyr 在库中(在其他对我不起作用的解决方案中阅读)。我看不到这个问题,因为情节在 rstudio 中有效并在 rmarkdown 中显示并且它没有编织

这是 rmarkdown 中链接到错误的块

#next line is line 239
ONE1 <- ggplot(Italy,  aes(Date, as.numeric(FirstDosePC))) +
  geom_col(fill = "red", alpha = .9, width = 7) +  theme_minimal(base_size = 8) + 
#Note minimal theme
  xlab(NULL) + ylab(NULL) + scale_x_date(date_labels = "%Y/%m/%d")
OneTwo <- ONE1 + geom_col(data=Ireland,  aes(Date, 
    as.numeric(FirstDosePC)),  
    fill="Green",  alpha = .9,width = 5)
OneTwoThree <- OneTwo + geom_col(data=Latvia,  aes(Date, 
    as.numeric(FirstDosePC)),  
    fill="black",  alpha = .9, width = 2)
OneTwoThree + labs(title="Ireland, Italy, & Latvia - First Dose comparision",
    subtitle="ITALY = RED, IRELAND = GREEN, LATVIA = BLACK",              
    caption = "(ECDC, 2021)",
    x="Date Administered",
   y="% Population treated")

菜鸟错误。我在允许在 rmarkdown 和 r 工作区中构建绘图的块的第一部分中有评论。

但是评论 # 正在停止编织过程。

删除评论 - 发生编织(删除#Note 最小主题...以帮助您查看解决方案)

之前

ONE1 <- ggplot(Italy,  aes(Date, as.numeric(FirstDosePC))) +
  geom_col(fill = "red", alpha = .9, width = 7) +  theme_minimal(base_size = 8) + 
#Note minimal theme
  xlab(NULL) + ylab(NULL) + scale_x_date(date_labels = "%Y/%m/%d")

之后

ONE1 <- ggplot(Italy,  aes(Date, as.numeric(FirstDosePC))) +
  geom_col(fill = "red", alpha = .9, width = 7) +  theme_minimal(base_size = 8) + 

  xlab(NULL) + ylab(NULL) + scale_x_date(date_labels = "%Y/%m/%d")