如何为源节点和目标节点制作没有颜色的 sankyplots 以及如何做图例以显示链接组的不同颜色

Question

我正在处理网络数据并希望使用 networkd3 package in r 中的 sankeyNetwork() 将其可视化。在我的数据框中，我有一个源节点和一个目标节点、值和一个分组列组。

如何在不给节点着色的情况下制作桑基图（源节点和目标节点都没有颜色）？
我想用变量组 LinkGroup = "group" 给 link 行着色，我想知道如何制作图例来显示 link 的不同颜色是实际上代表组变量。

这是代码和数据框...

# Libraries
library(dplyr)
library(tidyr)
library(tibble)
library(networkD3)

# Load dataset from github

data <- read.table("https://raw.githubusercontent.com/holtzy/data_to_viz/master/Example_dataset/13_AdjacencyDirectedWeighted.csv", header=TRUE) %>%
  rownames_to_column() %>%
  gather(key = "key", value = "value", -rowname) %>%
  filter(value > 0) %>% 
  rename(source = rowname,  target =key) %>%
  select("source", "target", "value") %>%
  mutate(group = c(rep("A", 10), rep("B",7), rep("C", 8), rep("D", 10)))
nodes <- data.frame(name=c(as.character(data$source), as.character(data$target)) %>% unique())

data$IDsource=match(data$source, nodes$name)-1 
data$IDtarget=match(data$target, nodes$name)-1

# Make the Network
sankeyNetwork(Links = data,
              Nodes = nodes,
              Source = "IDsource",
              Target = "IDtarget",
              Value = "value",
              NodeID = "name", 
              sinksRight=FALSE,
              nodeWidth=40,
              fontSize=13,
              nodePadding=20,
              LinkGroup = "group")

Answer 1

您可以继续让 link 节点根据其组自动选择颜色，并使用 NodeGroup = NULL option/argument[=16 有效地关闭节点的着色=]

sankeyNetwork(Links = data,
              Nodes = nodes,
              Source = "IDsource",
              Target = "IDtarget",
              Value = "value",
              NodeID = "name", 
              sinksRight=FALSE,
              nodeWidth=40,
              fontSize=13,
              nodePadding=20,
              LinkGroup = 'group',
              NodeGroup = NULL)

networkD3 没有任何内置图例创建选项，但是，如果您想自己制作图例，您可能需要使用一组一致的颜色，以便您可以使用它们无论你用什么来创造传奇。你可以这样做...

colourScale <- 
  'd3.scaleOrdinal()
     .domain(["A", "B", "C", "D"])
     .range(["red", "blue", "green", "yellow"])'

sankeyNetwork(Links = data,
              Nodes = nodes,
              Source = "IDsource",
              Target = "IDtarget",
              Value = "value",
              NodeID = "name", 
              sinksRight=FALSE,
              nodeWidth=40,
              fontSize=13,
              nodePadding=20,
              LinkGroup = 'group',
              NodeGroup = NULL,
              colourScale = colourScale)

如何为源节点和目标节点制作没有颜色的 sankyplots 以及如何做图例以显示链接组的不同颜色

how to make sankyplots with no color for source and target node and how to do legend to show the different colors of linkgroup

javascript

r

d3.js

sankey-diagram

htmlwidgets