Networkx 和 graphviz。如何抑制点输出中的节点和边缘位置？

Question

使用这个简单的 networkx 脚本。

import networkx as nx

g = nx.DiGraph()
g.add_edge("a","b")
g.add_edge("a","c")
g.add_node("D")

dotter = nx.nx_agraph.to_agraph(g)
dotter.layout("dot")
dot = dotter.to_string()

with open("test_w_pos.dot","w") as fo:
    fo.write(dot)

输出为：

strict digraph "" {
    graph [bb="0,0,162,108"];
    node [label="\N"];
    a    [height=0.5,
        pos="63,90",
        width=0.75];
    b    [height=0.5,
        pos="27,18",
        width=0.75];
    a -> b   [pos="e,35.634,35.269 54.285,72.571 50.04,64.081 44.846,53.693 40.134,44.267"];
    c    [height=0.5,
        pos="99,18",
        width=0.75];
    a -> c   [pos="e,90.366,35.269 71.715,72.571 75.96,64.081 81.154,53.693 85.866,44.267"];
    D    [height=0.5,
        pos="135,90",
        width=0.75];
}

我希望不具有任何pos、height和width属性，因为它们不同于运行运行并且很难在复杂图形上与之前的运行进行比较。

期望的输出

strict digraph "" {
    node [label="\N"];
    a;
    b;
    a -> b;
    c;
    a -> c;
    D;
}

两个 dot 文件在 svg 中给出基本相同的输出（见下文），所以我发现定位是不必要的，事实上我从未见过将此信息放入 dot 之前的文件。

我在 to_agraph 或 dotter.to_string 中找不到任何内容，但我没有注意到 dotter.layout(dot):

中可能存在额外的参数

agraph.py

    def layout(self, prog="neato", args=""):
        """Assign positions to nodes in graph.

是的，有了这个非常简单的文件，我可以在之后删除定位数据。但是在真实的图表中，会有很多其他颜色和标签属性与位置混合在一起。

具有位置属性的图像：

没有位置属性的图像：

Answer 1

试试 dotter.layout("canon") (https://graphviz.org/docs/outputs/canon/)。这将提供没有任何定位的（漂亮打印的）图表版本。

Answer 2

如果您只对 dot 文件感兴趣，您可以使用 pydot interface of networkx and call write_dot，例如

drawing.nx_pydot.write_dot(g, "test.dot")

Networkx 和 graphviz。如何抑制点输出中的节点和边缘位置？

Networkx and graphviz. How to suppress node and edge positions in dot output?

networkx

pygraphviz

期望的输出

agraph.py

具有位置属性的图像：

没有位置属性的图像：