conda install 和 conda build 导致不同的依赖版本

Question

我正在尝试构建一个包含 h5py 的包。使用 conda build 时，似乎安装了错误版本的依赖项。它安装 3.2.1-py37h6c542dc_0，其中包括 hdf5: 1.10.6-nompi_h6a2412b_1114。

问题是这个 hdf5 库似乎有这些设置：

(Read-Only) S3 VFD: yes

这对我来说是一个错误。当只是运行 conda install h5py==3.2.1 时，它会安装正确的版本 (hdf5-1.10.6-nompi_h3c11f04_101)。

为什么会有差异？

Answer 1

"为什么有区别？

使用 conda install h5py=3.2.1 还包括当前环境中的所有先前约束，而在 conda build 运行期间，仅根据包指定的要求创建新环境。也就是更像运行宁conda create -n foo h5py=3.2.1.

所以，这涵盖了该机制，但我们还可以查看特定的包依赖关系，以了解为什么当前环境限制为较旧的 hdf5-1.10.6-nompi_h3c11f04_101，OP 指出哪个是首选。这是两者的包装信息：

hdf5-1.10.6-nompi_h6a2412b_1114

$ mamba search --info conda-forge/linux-64::hdf5[version='1.10.6',build='nompi_h6a2412b_1114']

hdf5 1.10.6 nompi_h6a2412b_1114
-------------------------------
file name   : hdf5-1.10.6-nompi_h6a2412b_1114.tar.bz2
name        : hdf5
version     : 1.10.6
build       : nompi_h6a2412b_1114
build number: 1114
size        : 3.1 MB
license     : LicenseRef-HDF5
subdir      : linux-64
url         : https://conda.anaconda.org/conda-forge/linux-64/hdf5-1.10.6-nompi_h6a2412b_1114.tar.bz2
md5         : 0a2984b78f51148d7ff6219abe73509e
timestamp   : 2021-01-08 23:10:11 UTC
dependencies: 
  - libcurl >=7.71.1,<8.0a0
  - libgcc-ng >=9.3.0
  - libgfortran-ng
  - libgfortran5 >=9.3.0
  - libstdcxx-ng >=9.3.0
  - openssl >=1.1.1i,<1.1.2a
  - zlib >=1.2.11,<1.3.0a0

hdf5-1.10.6-nompi_h3c11f04_101

$ mamba search --info conda-forge/linux-64::hdf5[version='1.10.6',build='nompi_h3c11f04_101']

hdf5 1.10.6 nompi_h3c11f04_101
------------------------------
file name   : hdf5-1.10.6-nompi_h3c11f04_101.tar.bz2
name        : hdf5
version     : 1.10.6
build       : nompi_h3c11f04_101
build number: 101
size        : 3.0 MB
license     : HDF5
subdir      : linux-64
url         : https://conda.anaconda.org/conda-forge/linux-64/hdf5-1.10.6-nompi_h3c11f04_101.tar.bz2
md5         : 9f1ccc4d36edf8ea15ce19f52cf6d601
timestamp   : 2020-07-31 12:26:29 UTC
dependencies: 
  - libgcc-ng >=7.5.0
  - libgfortran-ng >=7,<8.0a0
  - libstdcxx-ng >=7.5.0
  - zlib >=1.2.11,<1.3.0a0

这里的区别在于后者适用于旧版本的libgcc-ng、libstdcxx-ng和libgfortran-ng（9.3.0以下），并且对openssl 或 libcurl。因此，我们可以猜测调用 conda install h5py=3.2.1 的当前环境具有这些限制之一。

conda install 和 conda build 导致不同的依赖版本

conda install and conda build result in different dependency versions

python

hdf5

h5py

conda

conda-build