as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE) 中的错误：无法将 class 'structure("mmquery_bioc", package = "multiMiR")' 强制转换为 data.frame

Question

我无法获得 table 个结果。

命令： answer <- get_multimir(url = NULL, org = "hsa", mirna = "MIMAT0000450", target = NULL, disease.drug = "cancer", table = "validated", predicted.cutoff = NULL, predicted.cutoff.type = "p", predicted.site = "conserved", summary = FALSE, add.link = FALSE, use.tibble = TRUE, limit = NULL, legacy.out = FALSE)

当我尝试使用以下方法创建 table 时： write.table(answer,"C:\Users\Someone\Desktop\Rresults\data.csv", row.names=FALSE)

它导致以下错误：

Error in as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE) : cannot coerce class ‘structure("mmquery_bioc", package = "multiMiR")’ to a data.frame

Answer 1

get_multimir 用于从 multiMiR 包中检索预测和验证的 miRNA-target 相互作用及其疾病和药物关联。

它 returns class mmquery_bioc

的对象

错误：

Error in as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE) : cannot coerce class ‘structure("mmquery_bioc", package = "multiMiR")’ to a data.frame

通知您 R 不知道如何将此对象转换为数据框。

尚不完全清楚您要实现的目标，但如果我要猜测，也许您只需要此对象的 data 插槽：

write.table(answer@data,"C:\Users\Someone\Desktop\Rresults\data.csv", row.names=FALSE)

as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE) 中的错误：无法将 class 'structure("mmquery_bioc", package = "multiMiR")' 强制转换为 data.frame

Error in as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE) : cannot coerce class ‘structure("mmquery_bioc", package = "multiMiR")’ to a data.frame

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