如何抑制不是警告消息的红色进度消息？解决方案不起作用

Question

我有一个脚本，在该脚本中，我正在运行从包中获取命令：来自 ensembldb 包的 proteinToGenome()。

I 运行命令使用 for () {} 结构迭代，并且在每次迭代时它都会 return RED 输出更多的“进度”消息，无论 success/failure 的命令，不是警告消息：

Checking CDS and protein sequence lengths ... 1/1 OK

Fetching CDS for 1 proteins ... 1 found

或：

Fetching CDS for 1 proteins ... 1 found

Checking CDS and protein sequence lengths ... 0/0 OK

如何禁止这些消息？我发现的其他问题似乎不适用于这些问题，他们的解决方案似乎也无法阻止这些问题。我已经尝试了以下所有解决方案：

Suppress output of a function

我累了：

capture.output(for (x in length(DF)) { 
        OutputDF <- function(DF[x])
})

和：

sink(for (x in length(DF)) { 
        OutputDF <- function(DF[x])
})

也尝试过：

hush=function(code){
  sink("NUL") # use /dev/null in UNIX
  tmp = code
  sink()
  return(tmp)
}
hush(for (x in length(DF)) { 
        OutputDF <- function(DF[x])
})

此外，我使用 for 而不是 lapply() 的原因是因为我检查 OutputDF 是否为空，并使用 if(){}else{} 命令在 for(){}循环

Answer 1

怎么样：

suppressMessages(proteinToGenome(...))

您在模型中使用的参数替换 ...

如何抑制不是警告消息的红色进度消息？解决方案不起作用

How to suppress RED progress messages that are not warning messages? SOLUTIONS NOT WORKING

r

output

suppress

suppressmessage