XLConnect、rJava 和包构建

XLConnect, rJava and package building

我正在编写一个我想包含在 user-defined 包 (MYPACKAGE) 中的函数。函数如下:

readSchedule <- function(FILE){
    WB = loadWorkbook(FILE)
    WS= readWorksheet(WB, sheet = 'Sheet1',header = TRUE)
    return(WS)
}

其中 FILE 是我要读取的 Excel 文件的名称。编写此函数时,我希望它导入 XLConnect,因为这是它使用的包。我放置了 header 定义函数的代码:

@param FILE Excel file
@return Excel data
@export
@import XLConnect

我还在 MYPACKAGE 的 NAMESPACE 和 DESCRIPTION 文件中添加了 import(XLConnect)。该包构建良好(或者至少在第一次切割时它看起来构建正常)但是当我 运行 "Check Package" 它失败并给我以下错误:

* installing *source* package 'MYPACKAGE' ...
** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
*** arch - i386
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: fun(libname, pkgname)
  error: No CurrentVersion entry in Software/JavaSoft registry! Try re-installing Java and make sure R and Java have matching architectures.
Error: loading failed
Execution halted
*** arch - x64
ERROR: loading failed for 'i386'

我有 Java 的正确版本,可以很好地加载 rJava。我试过导入 rJava(类似于 XLConnect),但我得到了同样的错误。下面是我的会话信息:

R version 3.1.2 (2014-10-31)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] MYPACKAGE

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] chron_2.3-45     data.table_1.9.4 digest_0.6.8     lubridate_1.3.3  memoise_0.2.1    plyr_1.8.1      
 [7] Rcpp_0.11.1      reshape2_1.4     rJava_0.9-6      stringr_0.6.2    tools_3.1.2      XLConnect_0.2-7 

看起来您正在 Windows 64 位机器上构建您的软件包,并且安装了 64 位版本的 Java。当使用 R CMD check 检查您的包时,R 默认情况下还会尝试在其他子架构(i386、32 位)上检查您的包,在您的情况下,还需要安装 [=19= 的 32 位].

如果您还想检查您的软件包 i386,您可以额外安装 Java 32 位。另一种选择是将选项 --no-multiarch 传递给您的 R CMD check 调用,例如R CMD check --no-multiarch MYPACKAGE.