循环以按行和 运行 函数删除具有 NA 的列（对每一行执行此操作）
Loop to remove columns with NAs by row and run function (do this for each row)
我正在 运行 包 vegan 中的功能多样性，但我的数据集包含许多 NA。该函数按行（即图）计算多样性，但如果该行具有 NA，则将 return NA。我看了看，但找不到使用此功能的 NA 解决方案。唯一（也许）可以解决这个问题的方法是每次我 运行 函数时删除带有 NA 的列，但是手动执行此操作将永远花费。我不能简单地从我的数据集中删除所有 NA，因为这也会删除整行并且我有一些包含数据的列。
如何循环按行删除带有 NA 的列，运行 函数，存储多样性输出，然后对下一行执行相同操作直到最后一行？
数据集示例：
|species1|species2|species3|species4|species5|species6|species7|species8|
|________|________|________|________|________|________|________|________|
|NA |90 |75 |NA |NA |NA |NA |60 |
|90 |NA |75 |NA |90 |NA |90 |60 |
|NA |NA |NA |NA |NA |NA |NA |33 |
|60 |90 |75 |NA |30 |NA |NA |46 |
|NA |90 |75 |NA |NA |NA |NA |NA |
以及多样性函数：
library("vegan")
diversity(dataset, "invsimpson")
非常感谢任何帮助。谢谢！
你的数据集是物种 x 位点矩阵吗？即行是 sites/samples，列是物种？
如果是这样，用零表示在那个地点没有检测到一个物种是正常的，而不是“NA”。我知道仅仅因为你没有检测到一个物种，并不意味着它不存在，但大多数生态群落数据分析都会考虑到这一点。
我正在 运行 包 vegan 中的功能多样性，但我的数据集包含许多 NA。该函数按行（即图）计算多样性，但如果该行具有 NA，则将 return NA。我看了看，但找不到使用此功能的 NA 解决方案。唯一（也许）可以解决这个问题的方法是每次我 运行 函数时删除带有 NA 的列，但是手动执行此操作将永远花费。我不能简单地从我的数据集中删除所有 NA，因为这也会删除整行并且我有一些包含数据的列。
如何循环按行删除带有 NA 的列，运行 函数，存储多样性输出，然后对下一行执行相同操作直到最后一行？
数据集示例：
|species1|species2|species3|species4|species5|species6|species7|species8|
|________|________|________|________|________|________|________|________|
|NA |90 |75 |NA |NA |NA |NA |60 |
|90 |NA |75 |NA |90 |NA |90 |60 |
|NA |NA |NA |NA |NA |NA |NA |33 |
|60 |90 |75 |NA |30 |NA |NA |46 |
|NA |90 |75 |NA |NA |NA |NA |NA |
以及多样性函数：
library("vegan")
diversity(dataset, "invsimpson")
非常感谢任何帮助。谢谢！
你的数据集是物种 x 位点矩阵吗？即行是 sites/samples，列是物种？
如果是这样，用零表示在那个地点没有检测到一个物种是正常的，而不是“NA”。我知道仅仅因为你没有检测到一个物种，并不意味着它不存在，但大多数生态群落数据分析都会考虑到这一点。