重新排序图例生存

Question

我做了一个如下所示的回归：

survfit(Surv(YearsToEvent, Event) ~ CancerType, data = RegressionData)

从那里我得到这样的输出 table（为了便于阅读，我删除了一些列）：

          n 
Cancer A  100  
Cancer B  200

但是，当我使用 ggsurvplot 绘制输出时，我有一个 plot + a table 和“number at risk”，我希望能够手动调整图例的顺序.也就是说，我希望能够将 Cancer B 放在 Cancer A 之前。我在 SO 上发现了一个类似的线程：How to reorder strata in survfit object for ggsurvplot legend?。但是，我没有在其中找到任何答案。我试图在回归之前对数据框 RegressionData 进行排序，但没有成功。

有人能帮我吗？

Answer 1

这里是一个例子，你可以如何实现你想要的：

主要步骤是将分组变量转换为因子class。然后你可以手动定义级别：

其他步骤相同：

library(survminer)
library(survival)
library(tidyverse)

lung1 <- lung %>% 
  mutate(sex = factor(sex, levels = c(2, 1)))
  
ggsurvplot(
  fit = survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung1),
  risk.table = TRUE,
  xlab = "Days", 
  ylab = "Overall survival probability")

重新排序图例生存

Reorder legend survfit

r

survival-analysis