ggspatial：geom_sf 因 coord_sf 中的某些 xlim 值而失败

Question

我正在尝试做的事情：使用 ggspatial::geom_sf()、使用 coord_sf() 或 ggspatial::layer_spatial() 和 ggspatial::annotation_spatial 的组合来绘制空间对象() 指定绘图的范围。

此 ggplot/ggspatial 行为已在多篇文章中进行了描述，但“解决方案”只是临时的黑客攻击，无法确保问题不会再次发生。看：

此代码工作正常：

require(sf); require(ggspatial); require(rnaturalearth)    
country_polygons <- st_as_sf(ne_countries())
ggplot() + geom_sf(data=country_polygons)

这样做：

ggplot() + geom_sf(data=country_polygons) + coord_sf(xlim=c(-100,100), ylim=c(-60,60))

但是：

ggplot() + geom_sf(data=country_polygons) + coord_sf(xlim=c(-160,150), ylim=c(-60,60))

导致错误： st_cast.POINT(X[[i]], ...) 错误：无法从 POINT

创建 MULTILINESTRING

显然这不应该发生。我不明白为什么 geom_sf 调用 st_cast.POINT() 因为输入中不应该有任何点。我尝试了三种不同的世界地图（GADM 3.6 shapefile，rworldmap::countriesLow 和 rnaturalearth 之一），所以它似乎不是特定于数据集的。

使用这些 x 和 y 极限值，即使是简单的 sf 点对象也无法绘制！

set.seed(80085)
tibble(Lon=runif(1000,-180,180),
       Lat=runif(1000,-90,90)) %>% 
  st_as_sf(coords=1:2, remove=F, crs=4326) -> random_points

random_points %>% 
      ggplot() + geom_sf() + coord_sf(xlim=c(-160,150), ylim=c(-60,60))

错误消息又是“无法从 POINT 创建 MULTILINESTRING”，我不知道为什么它会尝试创建 MULTILINESTRING。

更新：此处建议的解决方案不起作用： Why do some xlims and ylims produce this error in ggplot and sf?

random_points %>% 
  st_crop(xmin=-160, xmax=150, ymin=-60, ymax=60) %>% 
  ggplot() + geom_sf()

奇怪的是，只有 150oE 和 160oW 之间的点，即 180 度经度附近的太平洋上空的点被保存下来。我尝试使用从 0 到 360 的经度并交换 xmin 和 xmax，但无济于事。

撇开 st_crop 的错误行为，传递正确的裁剪对象会再次出现相同的错误：

random_points %>% 
  filter(Lon<150, Lon>-160, Lat>-60, Lat<60) %>% 
  ggplot() + geom_sf()

> Error in st_cast.POINT(x[[1]], to, ...) : 
  cannot create MULTILINESTRING from POINT
In addition: Warning message:
In st_cast.GEOMETRYCOLLECTION(X[[i]], ...) :
  only first part of geometrycollection is retained

更新结束

是否有解决方案或解决方法？

Answer 1

我认为这与 s2 几何引擎的异常行为有关。

TL;DR：考虑在您的代码中使用 sf_use_s2(F)。

长版：

library(sf)
library(dplyr)
library(mapview)

set.seed(80085)

random_points <- tibble(Lon = runif(1000,-180,180),
                        Lat = runif(1000,-90,90)) %>% 
  st_as_sf(coords=1:2, remove=F, crs=4326) 


mapview(random_points)  # this is "truth"

area_of_interest <- matrix(c(-160, -60, 
                             150, -60, 
                             150, 60, 
                             -160, 60,
                             -160, -60), 
                           byrow = TRUE, 
                           ncol = 2) %>%
  list() %>% 
  st_polygon() %>% 
  st_sfc(crs = 4326) 

mapview(area_of_interest) # this is our area of interest

# an atribute of points - in AOI or not?
random_points$aoi <- st_contains(area_of_interest,
                                 random_points,
                                 sparse = F) %>% 
  t() %>% 
  c()

# a visual overview; this is _not_ expected!
# the topology of AOI was not applied correctly
mapview(random_points, zcol = "aoi")

# let us try turning S2 engine off, and fall back to good old GEOS
sf_use_s2(F)

# exactly the same code as before!!
random_points$aoi <- st_contains(area_of_interest,
                                 random_points,
                                 sparse = F) %>% 
  t() %>% 
  c()

# but the output behaves much better!
mapview(random_points, zcol = "aoi")

# a seletion of random points; cropped to area of interest
library(ggplot2)

random_points %>% 
  filter(aoi) %>% 
  ggplot() + geom_sf(pch = 4, color = "red")

ggspatial：geom_sf 因 coord_sf 中的某些 xlim 值而失败

ggspatial: geom_sf fails with certain xlim values in coord_sf

r

ggplot2

sf

ggspatial