使用 incanter 从 clojure 中的数组获取均值和协方差矩阵

Question

我正在尝试使用 incanter 从 1000x2 的数据结构中获取数组均值和协方差矩阵。

我的测试用例是这样的

(ns test.mean-cov
  (:require clojure.string
            [incanter.core :as in-core]
            [incanter.stats :as in-stats])
  (:use clojure.java.io))

(def test-mat [[1 2] [2 2]])

(in-stats/mean test-mat)

我是 LightTable 中的运行。

我得到的错误是这样的：

java.lang.ClassCastException: clojure.lang.PersistentList cannot be cast to java.lang.Number
        Numbers.java:1104 clojure.lang.Numbers.double_array
           stats.clj:1492 incanter.stats/mean

我不能完全理解这一点，不幸的是我的谷歌搜索没有帮助。有人可以提供一个简单的解释和解决方案吗？

自然地，一种糟糕的做法是

(def c1 (first (transpose test-mat)))
(def c2 (second (transpose test-mat)))

(def data-cov-mat [[(in-stats/covariance c1 c1) (in-stats/covariance c1 c2)] [(in-stats/covariance c2 c1) (in-stats/covariance c2 c2)]])

完全披露：我是 clojure 的新手。

谢谢

Answer 1

对于矩阵协方差，您需要使用以下内容：

(in-stats/covariance (in-core/matrix test-mat))

对于矩阵均值向量：

(mapv in-stats/mean (in-core/trans test-mat))

使用 incanter 从 clojure 中的数组获取均值和协方差矩阵

Getting the mean and covariance matrix from array in clojure using incanter

java

clojure

incanter