在 R 中标记大序列化数据（fst & Hmisc）

Question

我有一个关于在使用 fst 包时如何保存标记数据的问题。我一直在使用Hmisc包来标注数据，比如：

library(fst)
library(Hmisc)

# make an example dataset
df <- data.frame(id = letters[1:4],
                 val = 1:4)

# apply labels to dataframe
label(df$id) <- "identifier"
label(df$val) <- "value"

label(df)
         id          val 
"identifier"      "value"

但我的实际数据非常大，所以我将其保存为 fst 而不是 rds。不过最近，我注意到这似乎让我的标签消失了：

fp <- '~/filepath/example_code_data/label_ex.fst'

# save as fst
write_fst(df, fp)

# open data again
df2 <- read_fst(fp)

label(df2)
 id val 
 ""  ""

当我将数据保存为 rds 时，标签没有问题。如果能更深入地了解正在发生的事情或解决方案，我们将不胜感激。

Answer 1

对于以后遇到类似问题的任何人来说，这似乎是 known bug 的 fst。该线程的一位有用的评论员建议 qs 作为保留标签的类似包，尽管我不希望失去 fst 的随机列访问以及其他不错的功能。

在 R 中标记大序列化数据（fst & Hmisc）

Labelling big serialized data in R (fst & Hmisc)

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label

r

bigdata

hmisc