如何使用 sed 命令将 fasta 序列中的 trim 中的 header 转换为物种名称并保留序列的主要文本？
How to trim the header in a fasta sequence to the species name and keeping the main text of the sequence using sed command?
fasta文件名：STD_PRO_1.fasta
我在那个 fasta 文件中有多个 header：
>ENA|AB000176|AB000176.1 甘露糖基转移酶的大肠杆菌 DNA，phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase:phosphoribosyl-AMP 环化水解酶，部分 cds。
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTCACATACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA
GAGATGCTACCCCCGCCGTTGCTGCGGGGGCCAACGCGTTAATGCCGATTCTTCAGATTA
TCAATCACTTCTCCGAGATCCAGCCCTTGATCCTGCAACAACACCAGCAGGTGATACATC公司
AAATCAGATGCCTCGTTGGTCAGTTCAAGCGGTCATGTACTGTCGCTGCCAGTGCGGTT
>ENA|AB000178|AB000178.1 甘露糖基转移酶的大肠杆菌 DNA，phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase:phosphoribosyl-AMP 环化水解酶，部分 cds。
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTCACATACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA
GAGATGCTACCCCCGCCGTTGCTGCGGGGGCCAATGCGTTAATGCCGATTCTTCAGATTA
TCAATCACTTCTCCGAGATCCAGCCCCTGATCCTGTAACAGCACCAGCAGGTGATACATC公司
AAATCAGATGCCTCGTTGGTCAGCTCAAAGCGGTCATGTACCGTTGGTGCCAGTGCGGTT
只保留header中的物种名称如下：
>大肠杆菌
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTCACATACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA
GAGATGCTACCCCCGCCGTTGCTGCGGGGGCCAACGCGTTAATGCCGATTCTTCAGATTA
TCAATCACTTCTCCGAGATCCAGCCCTTGATCCTGCAACAACACCAGCAGGTGATACATC公司
AAATCAGATGCCTCGTTGGTCAGTTCAAGCGGTCATGTACTGTCGCTGCCAGTGCGGTT
>大肠杆菌
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTCACATACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA
GAGATGCTACCCCCGCCGTTGCTGCGGGGGCCAATGCGTTAATGCCGATTCTTCAGATTA
TCAATCACTTCTCCGAGATCCAGCCCCTGATCCTGTAACAGCACCAGCAGGTGATACATC公司
AAATCAGATGCCTCGTTGGTCAGCTCAAAGCGGTCATGTACCGTTGGTGCCAGTGCGGTT
之前：
$ sed -n l test.fasta
>ENA|AB000176|AB000176.1 Escherichia coli DNA for mannosyl transferase$
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTACACTACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTA$
$
>ENA|AB000178|AB000178.1 Escherichia coli DNA for mannosyl transferase$
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTACACTACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTA$
之后：
$ sed '/^>/{ s/[^ ]* />/; s/ DNA.*//; s/ gene.*//; }' test.fasta
>Escherichia coli
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTACACTACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTA
>Escherichia coli
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTACACTACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTA
fasta文件名：STD_PRO_1.fasta
我在那个 fasta 文件中有多个 header：
>ENA|AB000176|AB000176.1 甘露糖基转移酶的大肠杆菌 DNA，phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase:phosphoribosyl-AMP 环化水解酶，部分 cds。 GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTCACATACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTACCCCCGCCGTTGCTGCGGGGGCCAACGCGTTAATGCCGATTCTTCAGATTA TCAATCACTTCTCCGAGATCCAGCCCTTGATCCTGCAACAACACCAGCAGGTGATACATC公司 AAATCAGATGCCTCGTTGGTCAGTTCAAGCGGTCATGTACTGTCGCTGCCAGTGCGGTT
>ENA|AB000178|AB000178.1 甘露糖基转移酶的大肠杆菌 DNA，phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase:phosphoribosyl-AMP 环化水解酶，部分 cds。 GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTCACATACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTACCCCCGCCGTTGCTGCGGGGGCCAATGCGTTAATGCCGATTCTTCAGATTA TCAATCACTTCTCCGAGATCCAGCCCCTGATCCTGTAACAGCACCAGCAGGTGATACATC公司 AAATCAGATGCCTCGTTGGTCAGCTCAAAGCGGTCATGTACCGTTGGTGCCAGTGCGGTT
只保留header中的物种名称如下：
>大肠杆菌 GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTCACATACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTACCCCCGCCGTTGCTGCGGGGGCCAACGCGTTAATGCCGATTCTTCAGATTA TCAATCACTTCTCCGAGATCCAGCCCTTGATCCTGCAACAACACCAGCAGGTGATACATC公司 AAATCAGATGCCTCGTTGGTCAGTTCAAGCGGTCATGTACTGTCGCTGCCAGTGCGGTT
>大肠杆菌 GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTCACATACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTACCCCCGCCGTTGCTGCGGGGGCCAATGCGTTAATGCCGATTCTTCAGATTA TCAATCACTTCTCCGAGATCCAGCCCCTGATCCTGTAACAGCACCAGCAGGTGATACATC公司 AAATCAGATGCCTCGTTGGTCAGCTCAAAGCGGTCATGTACCGTTGGTGCCAGTGCGGTT
之前：
$ sed -n l test.fasta
>ENA|AB000176|AB000176.1 Escherichia coli DNA for mannosyl transferase$
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTACACTACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTA$
$
>ENA|AB000178|AB000178.1 Escherichia coli DNA for mannosyl transferase$
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTACACTACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTA$
之后：
$ sed '/^>/{ s/[^ ]* />/; s/ DNA.*//; s/ gene.*//; }' test.fasta
>Escherichia coli
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTACACTACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTA
>Escherichia coli
GACCATATGATTGACGCCTATGTCAATCTCTACACTACATTGCTGGAAAGCAAATCCTGA GAGATGCTA