R Markdown 文件的 YAML Header - 添加带选项的 LaTeX 包会抛出错误（有时）

Question

在 R Markdown Cookbook 之后（以及此处的一些帖子），我正在尝试在 YAML header 中为我的 R Markdown 插入一个 collection 的 LaTeX 包文件。

当我 copy/paste 来自该网站的 header 进入我的文件时：

output: 
  pdf_document:
    extra_dependencies:
      caption: ["labelfont={bf}"]
      hyperref: ["unicode=true", "breaklinks=true"]
      lmodern: null

我收到错误：! LaTeX Error: Option clash for package hyperref.只有当我在方括号中包含选项时才会发生这种情况 - 如果我删除它们，一切都会按预期进行。

在类似的情况下，我尝试以相同的方式添加 babel 包。当我这样包含它时：

    extra_dependencies:
      babel: ["hebrew", "english"]

我得到错误：! You can't use end-group 字符 }' 在 \the.`

之后

我更困惑了（如果可能的话），因为当我包含 threeparttable 包的选项时，一切运行都没有问题。

这是一个要测试的文件：

---
title: "R Notebook"
author: 
   - Me
date: "Last compiled on `r format(Sys.time(), '%d %B %Y')`"
output: 
  pdf_document: 
    highlight: tango
    keep_tex: yes
    number_sections: yes
    toc: yes
    fig_caption: yes
    extra_dependencies:
      cjhebrew: null
      babel: ["hebrew", "english"]
---


# Section 1

Test

当我将其编织成 PDF 时，出现错误：

！你不能在 \the 之后使用 `end-group 字符 }'。 \everypar #1->\o@everypar {\rl@everypar #1}

日志文件位于 this repo。

Answer 1

rmarkdown 自动加载 hyperref 包。您无法使用冲突的选项再次加载它。

您可以使用 \hypersetup{...} 更改其设置：

---
output: 
  pdf_document:
    keep_tex: true
header-includes:
  - \hypersetup{breaklinks=true}
---

test

但是你确定你需要所有的选项和包吗？

rmakdown已经使用了unicode选项，所以不需要再添加
rmarkdown也会自动加载lmodern包，无需再次加载

另一个问题是babel和microtype包的交互，rmarkdown默认加载。使用真正的乳胶，您可以简单地避免加载除厨房水槽之外的每个包裹，并且您永远不会遇到这个问题，或者至少您可以将 nopatch 选项直接添加到 microtype （如果您真的需要它）...但是 rmarkdown 使这变得不必要地复杂化。

这是一个肮脏的 hack，希望没有其他包也使用这个名称作为选项：

---
title: "R Notebook"
author: 
   - Me
date: "Last compiled on `r format(Sys.time(), '%d %B %Y')`"
output: 
  pdf_document: 
    highlight: tango
    keep_tex: yes
    number_sections: yes
    toc: yes
    fig_caption: yes
    extra_dependencies:
      cjhebrew: null
      babel: ["hebrew", "english"]
classoption: "nopatch"
---


# Section 1

Test

R Markdown 文件的 YAML Header - 添加带选项的 LaTeX 包会抛出错误（有时）

YAML Header for R Markdown file - Adding LaTeX packages with options throws errors (sometimes)

latex

yaml

r

reproducible-research