在 R 中旋转 CreateTableOne 以将级别显示为列 headers？

Question

我正在尝试使用 CreateTableOne 函数在 R 中生成一些描述性摘要 table。我有一系列变量都具有相同的响应 options/levels（是或否），并希望生成一个宽 table，其中级别是列标题，如下所示：

Variable	Yes	No
Var1	1	7
Var2	5	2

但是 CreateTableOne 生成嵌套的长 tables，其中有一列用于 Level，其中 Yes 和 No 是行中的值，如下所示：

Variable	Level	Value
Var1	Yes	1
Var1	No	7

有没有办法在仍然使用此功能的同时调整 table 以获得我想要的功能，或者我应该改用其他功能？

这是我当前的代码：

    vars <- c('var1', 'var2')
    Table <- CreateTableOne(vars=vars, data=dataframe, factorVars=vars)
    Table_exp <- print(Table, showAllLevels = T, varLabels = T, format="f", test=FALSE, noSpaces = TRUE, printToggle = FALSE)
    write.csv(Table_exp, file = "Table.csv")

谢谢！

Answer 1

您只能使用 pivot_wider 来制作 table。这是您的数据：

library(tidyverse)
  dataframe = data.frame(Variable = c("Var1", "Var1", "Var2", "Var2"),
                         Level = c("Yes", "No", "Yes", "No"),
                         Value = c(1, 7, 5, 2))

您的数据：

  Variable Level Value
1     Var1   Yes     1
2     Var1    No     7
3     Var2   Yes     5
4     Var2    No     2

您可以使用此代码使更宽 table:

dataframe %>% 
    pivot_wider(names_from = "Level", values_from = "Value")

输出：

# A tibble: 2 × 3
  Variable   Yes    No
  <chr>    <dbl> <dbl>
1 Var1         1     7
2 Var2         5     2

Answer 2

所以我从同事那里得到了这个问题的答案，它与 Quinten 的建议非常相似，但有一些额外的步骤来解释我的原始数据的结构。

我在问题中提供的示例 tables 是我想要的输出，而不是我的原始数据示例。数字值不是我数据集中的值，而是计算的记录数，下面的解决方案包括执行该计算的步骤。

这是我的原始数据的样子，实际上它的结构很宽：

Participant_ID	Var1	Var2	Age
1	Yes	No	20
2	No	No	30

我们首先创建了一个仅包含相关变量的子集：

subset <- data |> select(Participant_Id, Var1, Var2)

然后首先将数据旋转更长的时间，以便计算我想要的输出计数 table。在此代码中，我们指定我们不想旋转 Participant_ID 并创建名为 Vars 和 Response 的列。

subsetlong <- subset |> pivot_longer(-c("Participant_Id"), names_to = "Vars", values_to="Response")

这是 subsetlong 的样子：

Participant_ID	Vars	Response
1	Var1	Yes
1	Var2	No
2	Var1	No
2	Var2	No

然后我们通过 Vars 计算计数，将其放入一个名为 counts 的新数据框中：

counts <- subsetlong |> group_by(Vars) |> count(Response)

这才是最重要的：

Vars	Response	n
Var1	Yes	1
Var1	No	7
Var2	Yes	5
Var2	No	2

现在计算已经完成，我们再次将其转向宽，指定任何 NA 都应显示为 0：

counts_wide <- counts |> pivot_wider(names_from="Response", values_from="n", values_fill = 0)

终于得到了想要的结构：

Vars	Yes	No
Var1	1	7
Var2	5	2

在 R 中旋转 CreateTableOne 以将级别显示为列 headers？

Pivoting CreateTableOne in R to show levels as column headers?

pivot

r

summary