如何根据 R 中的特定样本名称字符对列中的数据进行排序？

Question

我有一个数据框（在R中）需要根据样本名称的部分进行整理以进行分析。例如，每个样本都以这种格式编码在标题为“样本”的列中： 1.4.a.2021 1是星期 4是设备号 a是一周中的采样周期 2021 年。我想按“4”排序（数字范围为 1-12）。我可以按字符串中的特定字符排序吗？如果是这样的话？

Answer 1

听起来你的数据是这样的：

set.seed(1)

df <- data.frame(Sample = paste0("1.", sample(12), ".",sample(letters, 12), "2021"),
                 Data = runif(12))
df
#>        Sample      Data
#> 1   1.9.u2021 0.3823880
#> 2   1.4.j2021 0.8696908
#> 3   1.7.v2021 0.3403490
#> 4   1.1.n2021 0.4820801
#> 5   1.2.y2021 0.5995658
#> 6   1.5.g2021 0.4935413
#> 7   1.3.i2021 0.1862176
#> 8   1.8.o2021 0.8273733
#> 9   1.6.e2021 0.6684667
#> 10 1.11.t2021 0.7942399
#> 11 1.12.q2021 0.1079436
#> 12 1.10.w2021 0.7237109

要对其进行排序，我们可以找到字符串的数字部分，将其转换为数字并按其对数据框进行排序：

df[order(as.numeric(gsub("^.*\.(\d+)\..*$", "\1", df$Sample))),]
#>        Sample      Data
#> 4   1.1.n2021 0.4820801
#> 5   1.2.y2021 0.5995658
#> 7   1.3.i2021 0.1862176
#> 2   1.4.j2021 0.8696908
#> 6   1.5.g2021 0.4935413
#> 9   1.6.e2021 0.6684667
#> 3   1.7.v2021 0.3403490
#> 8   1.8.o2021 0.8273733
#> 1   1.9.u2021 0.3823880
#> 12 1.10.w2021 0.7237109
#> 10 1.11.t2021 0.7942399
#> 11 1.12.q2021 0.1079436

^{由 reprex package (v2.0.1)}

于 2022 年 3 月 20 日创建

如何根据 R 中的特定样本名称字符对列中的数据进行排序？

How to sort a data in a column based on specific sample name characters in R?

r

dataframe

sorting

character

analysis